183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6044 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 501 aa  1045    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  38.09 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  39.84 
 
 		 524 aa  352  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  35.77 
 
 		 472 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  30.89 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  33.01 
 
 		 357 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.72 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.65 
 
 		 699 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  30.67 
 
 		 341 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.41 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 547 aa  114  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  29.7 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  30.29 
 
 		 337 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.83 
 
 		 304 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  30.29 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  24.88 
 
 		 535 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 636 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.4 
 
 		 346 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  27.48 
 
 		 545 aa  101  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.62 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.64 
 
 		 540 aa  100  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.68 
 
 		 306 aa  98.6  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.14 
 
 		 355 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.14 
 
 		 356 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.74 
 
 		 345 aa  96.7  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  30.15 
 
 		 319 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  26.88 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.32 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.1 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  23.24 
 
 		 511 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.05 
 
 		 558 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.81 
 
 		 537 aa  94.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.05 
 
 		 357 aa  94  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 		 325 aa  93.6  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  30.56 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.18 
 
 		 532 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.03 
 
 		 352 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  27.07 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  27.01 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  24.94 
 
 		 519 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 		 319 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.42 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  23.83 
 
 		 525 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.33 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  23.99 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  29.39 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  22.24 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.68 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  24.2 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 534 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  27.74 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  24.37 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.8 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  27.06 
 
 		 542 aa  80.9  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  24.04 
 
 		 553 aa  80.1  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  22.88 
 
 		 536 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  25.57 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  22.65 
 
 		 552 aa  79.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  28.24 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  26.81 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  22.27 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  23.66 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  25.08 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  27.76 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.41 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.36 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  23.08 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  22.75 
 
 		 572 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 581 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  29.37 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  22.13 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.69 
 
 		 559 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  24.42 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  23.92 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  21.77 
 
 		 518 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.09 
 
 		 366 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.27 
 
 		 558 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.1 
 
 		 541 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.76 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  21.14 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  22.39 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  20.57 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  25.57 
 
 		 829 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  26.47 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  25.24 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 		 543 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  22.6 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>