133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1362 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  100 
 
 		 1090 aa  2236    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 		 1177 aa  544  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  29.99 
 
 		 1132 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  30.01 
 
 		 1132 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 		 1016 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 		 1110 aa  484  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  34.19 
 
 		 947 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  32.14 
 
 		 868 aa  365  2e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  37.26 
 
 		 1232 aa  362  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  33.33 
 
 		 859 aa  349  2e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  24.98 
 
 		 1143 aa  344  4e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 1068 aa  332  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.62 
 
 		 1211 aa  316  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  31.38 
 
 		 876 aa  273  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  30.06 
 
 		 792 aa  253  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 917 aa  247  9e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 774 aa  221  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  25.43 
 
 		 791 aa  184  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 759 aa  167  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 		 792 aa  163  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 		 792 aa  159  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  23.43 
 
 		 787 aa  147  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  24.81 
 
 		 789 aa  147  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 		 786 aa  144  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  24.51 
 
 		 787 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 789 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 789 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 787 aa  138  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  23.18 
 
 		 787 aa  135  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  24.51 
 
 		 787 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  21.06 
 
 		 797 aa  132  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  24.9 
 
 		 788 aa  131  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 		 773 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 787 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  22.18 
 
 		 789 aa  128  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  22.22 
 
 		 787 aa  128  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  22.09 
 
 		 787 aa  127  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  21.93 
 
 		 787 aa  127  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  22.29 
 
 		 787 aa  125  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  22.92 
 
 		 793 aa  124  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 		 787 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  23.64 
 
 		 789 aa  122  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  23.88 
 
 		 790 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  22.45 
 
 		 788 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  23.65 
 
 		 788 aa  119  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  22.14 
 
 		 787 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 		 790 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  22.33 
 
 		 788 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  23.5 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  24.21 
 
 		 788 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  21.34 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  24.4 
 
 		 789 aa  111  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  24.52 
 
 		 787 aa  109  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  22.3 
 
 		 793 aa  100  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  21.01 
 
 		 793 aa  100  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  22.98 
 
 		 800 aa  95.9  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  21.22 
 
 		 749 aa  90.9  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  21.77 
 
 		 791 aa  89.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 		 737 aa  90.1  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  21.48 
 
 		 786 aa  89  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  21 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 833 aa  66.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  25.85 
 
 		 424 aa  57  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  20.37 
 
 		 743 aa  57  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  20.85 
 
 		 889 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  21.81 
 
 		 780 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.4 
 
 		 850 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 		 805 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  20.98 
 
 		 887 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  22.26 
 
 		 838 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  21.1 
 
 		 854 aa  53.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 855 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  29.9 
 
 		 418 aa  52.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 		 847 aa  52  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  35.29 
 
 		 786 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  20.15 
 
 		 835 aa  51.6  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  30.3 
 
 		 419 aa  51.6  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  20.98 
 
 		 811 aa  51.2  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  21.31 
 
 		 887 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  22.73 
 
 		 851 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  22.43 
 
 		 817 aa  50.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  20.62 
 
 		 845 aa  49.7  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.61 
 
 		 631 aa  49.3  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  23.85 
 
 		 896 aa  48.9  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 		 786 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  20.99 
 
 		 662 aa  48.1  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  34.48 
 
 		 422 aa  47.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  34.48 
 
 		 422 aa  48.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 416 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 379 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  18.63 
 
 		 841 aa  47.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  20.74 
 
 		 853 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0224  hypothetical protein  21.19 
 
 		 852 aa  47.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  19.86 
 
 		 821 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  29.41 
 
 		 430 aa  47  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  34.21 
 
 		 829 aa  47  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0222  hypothetical protein  21.19 
 
 		 852 aa  47.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 		 735 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  29.5 
 
 		 779 aa  46.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 416 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>