99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA05480 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  100 
 
 		 944 aa  1941    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  40.48 
 
 		 816 aa  491  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  34.86 
 
 		 803 aa  388  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  34.81 
 
 		 651 aa  382  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  33.2 
 
 		 719 aa  368  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  30.88 
 
 		 664 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  32.73 
 
 		 932 aa  336  1e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  28.23 
 
 		 603 aa  288  4e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28 
 
 		 590 aa  259  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.41 
 
 		 601 aa  258  5e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  27.82 
 
 		 583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  27.3 
 
 		 601 aa  251  4e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  27.08 
 
 		 584 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  26.06 
 
 		 598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.14 
 
 		 588 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  26.41 
 
 		 584 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  25.94 
 
 		 584 aa  211  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  25.63 
 
 		 549 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  34.55 
 
 		 337 aa  184  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.33 
 
 		 583 aa  165  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.43 
 
 		 582 aa  149  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.97 
 
 		 556 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  23.62 
 
 		 568 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.44 
 
 		 550 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  22.97 
 
 		 567 aa  125  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  22.16 
 
 		 546 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  25.68 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.97 
 
 		 531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.05 
 
 		 547 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  25.76 
 
 		 513 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.05 
 
 		 573 aa  115  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.21 
 
 		 552 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  24 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.55 
 
 		 592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.68 
 
 		 553 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  26.17 
 
 		 520 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  26.17 
 
 		 520 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  26.17 
 
 		 520 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  22.67 
 
 		 576 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.64 
 
 		 610 aa  109  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  21.06 
 
 		 562 aa  108  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  27.2 
 
 		 527 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  24.17 
 
 		 534 aa  105  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25 
 
 		 509 aa  104  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.8 
 
 		 510 aa  104  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  21.32 
 
 		 573 aa  104  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.11 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.36 
 
 		 539 aa  102  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  25.64 
 
 		 513 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  20.94 
 
 		 573 aa  98.2  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  24.31 
 
 		 507 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.16 
 
 		 522 aa  95.1  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  25.1 
 
 		 508 aa  94.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  20.88 
 
 		 573 aa  91.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  23.36 
 
 		 1009 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  24.31 
 
 		 512 aa  89.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.78 
 
 		 592 aa  89  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  24.73 
 
 		 509 aa  87.8  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00930  DNA ligase (ATP), putative  22.73 
 
 		 1065 aa  83.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  22.92 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  20.97 
 
 		 1017 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  29.44 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.86 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.57 
 
 		 506 aa  67  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 517 aa  66.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  24.77 
 
 		 994 aa  65.1  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08014  ATP dependent DNA ligase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02430)  23.97 
 
 		 896 aa  64.7  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  23.27 
 
 		 858 aa  61.2  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  26.29 
 
 		 503 aa  60.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  29.48 
 
 		 537 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  24.62 
 
 		 847 aa  55.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  20.87 
 
 		 939 aa  54.3  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  24.04 
 
 		 532 aa  54.3  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  23.87 
 
 		 533 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  34.04 
 
 		 346 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  24.74 
 
 		 831 aa  51.6  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  25.46 
 
 		 758 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  25.46 
 
 		 758 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  25.46 
 
 		 758 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  21.8 
 
 		 622 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  23.81 
 
 		 902 aa  48.9  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  27.62 
 
 		 816 aa  48.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  23.4 
 
 		 797 aa  48.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  29.53 
 
 		 763 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0462  ATP-dependent DNA ligase  26.99 
 
 		 594 aa  47.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  23.24 
 
 		 522 aa  46.6  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  27.97 
 
 		 896 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45463  predicted protein  25.76 
 
 		 1307 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.857955  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50218  predicted protein  25.76 
 
 		 1307 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  30.64 
 
 		 550 aa  46.2  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  22.24 
 
 		 576 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  28.48 
 
 		 369 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  23.23 
 
 		 815 aa  45.8  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  23.97 
 
 		 351 aa  45.8  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  25.85 
 
 		 538 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  21.9 
 
 		 539 aa  45.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  26.21 
 
 		 408 aa  45.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  23.93 
 
 		 766 aa  45.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  21.88 
 
 		 533 aa  44.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>