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for query gene Bxe_B2122 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  100 
 
 
489 aa  981    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 
480 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 
475 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 
508 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 
475 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 
475 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 
506 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 
489 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 
493 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 
505 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 
501 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 
492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.2 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 
485 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.54 
 
 
490 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 
509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 
493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 
335 aa  127  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 
493 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
507 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 
493 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 
479 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 
345 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 
512 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 
325 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 
473 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  31.12 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 
311 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  30.73 
 
 
311 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 
304 aa  94.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 
362 aa  90.5  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 
338 aa  90.5  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 
366 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  25 
 
 
481 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 
472 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  30.12 
 
 
364 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  21.35 
 
 
637 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  34.46 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 
358 aa  77  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 
813 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  34.96 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  34.96 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 
814 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 
820 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 
820 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 
816 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 
845 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  36.8 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 
832 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  27.33 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
859 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  32.54 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 
814 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  33.05 
 
 
543 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  18.97 
 
 
484 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  18.97 
 
 
484 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 
636 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 
815 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 
636 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  24.05 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.76 
 
 
773 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 
299 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  29.41 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  37.27 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  20.9 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  28.99 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  28.47 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  23.21 
 
 
843 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  29.17 
 
 
809 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  29.17 
 
 
808 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  29.17 
 
 
809 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.17 
 
 
809 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 
832 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 
843 aa  67.4  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  23.21 
 
 
844 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  31.78 
 
 
380 aa  67  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 
295 aa  67  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 
874 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  27.94 
 
 
343 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  28.15 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
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NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  27.94 
 
 
343 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.107683 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  27.94 
 
 
343 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150216 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 
352 aa  66.6  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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