More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4128 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  88.6  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 770 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 208 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  26.26 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.32 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  25.26 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
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NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
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NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
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