208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5560 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  100 
 
 		 273 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  47.56 
 
 		 401 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  47.56 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  55.43 
 
 		 190 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  33.96 
 
 		 430 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  33.96 
 
 		 430 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  31.77 
 
 		 431 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  35.74 
 
 		 356 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  30.49 
 
 		 414 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  30.37 
 
 		 426 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  30.37 
 
 		 398 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  32.42 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  30 
 
 		 431 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  30.45 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  28.34 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  30.2 
 
 		 412 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  30.67 
 
 		 435 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  28.69 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  31.08 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 392 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  27.27 
 
 		 446 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  27.27 
 
 		 446 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  30.77 
 
 		 411 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  30.77 
 
 		 411 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  30.77 
 
 		 411 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  27.87 
 
 		 430 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  28.57 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  32.02 
 
 		 412 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  30.7 
 
 		 393 aa  98.6  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  30.04 
 
 		 471 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  28.74 
 
 		 428 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  29.75 
 
 		 397 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  28.92 
 
 		 407 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  29.34 
 
 		 411 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  29.76 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.71 
 
 		 390 aa  93.6  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 386 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.48 
 
 		 433 aa  92.8  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  33.14 
 
 		 401 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  35.27 
 
 		 388 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  32.5 
 
 		 276 aa  89  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  30.39 
 
 		 407 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  35.84 
 
 		 403 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  30.9 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.65 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  30.51 
 
 		 396 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  29.23 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  28.25 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  32.32 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  26.61 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  23.5 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.24 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.29 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  27.24 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  27.73 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  23.73 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  28.33 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.6 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.22 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  22.42 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  25.23 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.57 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  25.56 
 
 		 346 aa  67  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  31.55 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  27.88 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.2 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  25 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.99 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  23.6 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.6 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  27.23 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.48 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.62 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.79 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.6 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  23.11 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  27.97 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.79 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.9 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.39 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.59 
 
 		 435 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.61 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.46 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.51 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.71 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  23.67 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  25.78 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  23.29 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.43 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  24.36 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  21.7 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  32.37 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  36.62 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  20.16 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  25.47 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 424 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  26.55 
 
 		 403 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 469 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  30.82 
 
 		 385 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.03 
 
 		 404 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>