More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2663 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  29.59 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.96 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  29.41 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  30.17 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 191 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 177 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 154 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  25.2 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  29.57 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  26.92 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  29.17 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 167 aa  48.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  23.2 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.07 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>