105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3848 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3848  nuclease  100 
 
 		 186 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  43.57 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  44.44 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  44.44 
 
 		 214 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  43.38 
 
 		 227 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  40.69 
 
 		 227 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  34.62 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  41.48 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  33.52 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  35.77 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  29.35 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.14 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  42.25 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  33.74 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  36.23 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  37.04 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.94 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  30.13 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  36.3 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  33.99 
 
 		 534 aa  67.8  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  38.24 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  38.24 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  31.87 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  38.79 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  32.86 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  32.88 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  34.13 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  35.51 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  35 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  35.83 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  34.53 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  36.21 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  35.51 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  29.11 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  34.56 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  33.82 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  34.48 
 
 		 242 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4353  hypothetical protein  34.9 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  31.32 
 
 		 229 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  38.02 
 
 		 136 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  33.72 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  32.03 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  32.03 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  34.01 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  35.21 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  31.58 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.8 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.65 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  38.69 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  30.57 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.85 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  31.4 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.25 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.59 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.82 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  33.59 
 
 		 263 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.65 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  31.79 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  31.29 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30.13 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  30.6 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  31.85 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  35.38 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  31.39 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  29.68 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0524  nuclease (SNase domain protein)  33.77 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  33.82 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29232  predicted protein  29.77 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.39353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  32.06 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.1 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  29.71 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  33.59 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  34.62 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  32.54 
 
 		 256 aa  48.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  28.48 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.24 
 
 		 153 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  34.46 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.65 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  30.95 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  31.34 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9827  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  30.41 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  31.03 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  27.2 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  29.63 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  30.77 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  28.24 
 
 		 276 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  31.71 
 
 		 246 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  30.23 
 
 		 263 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  34.29 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  34.51 
 
 		 162 aa  44.7  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  29.86 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  32.59 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  37.14 
 
 		 186 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  30.67 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.88 
 
 		 157 aa  41.2  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>