59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29232 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_29232  predicted protein  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.39353 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00258  staphylococcal nuclease domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03430)  40.08 
 
 		 280 aa  162  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0130052 
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  35.35 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  39.52 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  32.21 
 
 		 334 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.33 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 		 158 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  25.53 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.83 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  31.11 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  35.43 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  30.49 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  26.92 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  29.71 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  25.57 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  27.63 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.85 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  31.06 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  31.11 
 
 		 162 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  30.71 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  26.16 
 
 		 164 aa  52  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.2 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  30.51 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.25 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.62 
 
 		 157 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  26.82 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  26.28 
 
 		 184 aa  49.3  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  24.85 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  28.57 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  30.08 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  27.75 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.09 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  32.46 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  31.58 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  28.93 
 
 		 169 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  27.34 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  27.34 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  28.21 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  27.64 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.91 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  28.57 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.2 
 
 		 187 aa  45.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  32.65 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  26.92 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  32.79 
 
 		 136 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  25.16 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  30.54 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  30.09 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  27.07 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  29.66 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  25.64 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  28.47 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  29.06 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  27.87 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  27.12 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  31.4 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  27.5 
 
 		 233 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  29.1 
 
 		 226 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>