58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02570 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  100 
 
 
282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00258  staphylococcal nuclease domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03430)  38.84 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0130052 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29232  predicted protein  35.35 
 
 
235 aa  132  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.39353 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  42.35 
 
 
164 aa  128  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  31.22 
 
 
334 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.8 
 
 
183 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.72 
 
 
227 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  24.58 
 
 
187 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  28.24 
 
 
171 aa  58.9  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  26.79 
 
 
179 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  29.17 
 
 
169 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  25.6 
 
 
175 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  26.04 
 
 
158 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.41 
 
 
180 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  28.68 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  30.43 
 
 
153 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  25 
 
 
174 aa  52.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.64 
 
 
221 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  26.51 
 
 
192 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  23.78 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  35.2 
 
 
169 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  28.38 
 
 
185 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  32.8 
 
 
185 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  27.34 
 
 
199 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  28.25 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  35.54 
 
 
189 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  35.54 
 
 
189 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  31.93 
 
 
136 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  28.03 
 
 
183 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  27.07 
 
 
185 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  30.58 
 
 
193 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  23.48 
 
 
209 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  25.48 
 
 
164 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  26.09 
 
 
192 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  27.81 
 
 
162 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  29.69 
 
 
220 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  26.88 
 
 
168 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  29.82 
 
 
161 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  28.32 
 
 
196 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  26.04 
 
 
168 aa  46.2  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  24.36 
 
 
148 aa  45.8  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  25.44 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  25.48 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  27.69 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.14 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.31 
 
 
153 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  22.92 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  25.76 
 
 
185 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  28.75 
 
 
157 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  30.77 
 
 
150 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  27.45 
 
 
184 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  24.26 
 
 
169 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  31.58 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  26.09 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  25 
 
 
372 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  26.37 
 
 
187 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  30.54 
 
 
208 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.35 
 
 
206 aa  42  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>