More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0097 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4386  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49 
 
 
1376 aa  891  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2679  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.98 
 
 
1303 aa  751  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20242  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0288  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.15 
 
 
1301 aa  754  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.120882  normal  0.0261022 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf212  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.89 
 
 
1197 aa  1017  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3687  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.05 
 
 
1374 aa  894  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.335052  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0319  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.01 
 
 
1302 aa  767  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.672728  hitchhiker  0.00209442 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0965  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  62.42 
 
 
1187 aa  992  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1339  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.44 
 
 
1497 aa  703  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0196  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.66 
 
 
1312 aa  753  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4499  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.85 
 
 
1375 aa  893  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0186  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  69.53 
 
 
1174 aa  1686  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04530  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.47 
 
 
1383 aa  672  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0997174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3314  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.38 
 
 
1368 aa  813  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3652  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.24 
 
 
1368 aa  803  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220946  hitchhiker  6.67023e-06 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1041  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.46 
 
 
1312 aa  775  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2848  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.46 
 
 
1368 aa  818  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1347  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.53 
 
 
1387 aa  879  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.039354 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4486  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.04 
 
 
1342 aa  820  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  6.17327e-14 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4483  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.04 
 
 
1342 aa  820  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.977508  hitchhiker  0.00153179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4364  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.04 
 
 
1342 aa  820  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.4876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0741  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.68 
 
 
1096 aa  1028  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0391  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.58 
 
 
1155 aa  932  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1751  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.58 
 
 
1103 aa  1016  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0123  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  98.47 
 
 
1177 aa  2372  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273838  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3868  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.42 
 
 
1376 aa  872  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4063  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.9 
 
 
1343 aa  830  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.918938  hitchhiker  0.000472151 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0974  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  61.92 
 
 
1070 aa  989  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000799261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0133  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  98.64 
 
 
1177 aa  2377  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.46144e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0178  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.85 
 
 
1434 aa  719  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1324  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.95 
 
 
1379 aa  887  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2866  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.07 
 
 
1342 aa  818  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131495  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0490  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  46.9 
 
 
1362 aa  826  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21478e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4560  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.04 
 
 
1342 aa  820  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63321e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4396  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.04 
 
 
1342 aa  820  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0669661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0926  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.85 
 
 
1371 aa  865  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2271  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.02 
 
 
1422 aa  856  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2106  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.08 
 
 
1384 aa  803  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0644464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0268  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.31 
 
 
1368 aa  810  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716165 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0042  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.91 
 
 
1366 aa  793  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.24956e-16 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16071  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.11 
 
 
1096 aa  969  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.614693  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0244  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  65.18 
 
 
1217 aa  806  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4325  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.41 
 
 
1143 aa  1068  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.0767673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0268  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  60.29 
 
 
1378 aa  670  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0702  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  45.71 
 
 
1368 aa  795  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6057  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.36 
 
 
1141 aa  1093  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0277  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.2 
 
 
1342 aa  821  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274525  normal  0.0126314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4324  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.8 
 
 
1343 aa  813  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.397573  unclonable  9.17955e-10 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.15 
 
 
1245 aa  1159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0310456  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.57 
 
 
1377 aa  845  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.310876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3364  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.64 
 
 
1358 aa  887  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2729  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  48.33 
 
 
1362 aa  880  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.466939 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1782  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.74 
 
 
1182 aa  884  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3860  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.39 
 
 
1342 aa  821  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00178402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2221  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.34 
 
 
1416 aa  669  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480629  decreased coverage  0.00212341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1947  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.49 
 
 
1377 aa  891  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0193  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.17 
 
 
1322 aa  821  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146327  hitchhiker  0.0018171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3687  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  62.74 
 
 
1278 aa  1518  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0355  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  55.05 
 
 
1187 aa  917  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2196  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  43.78 
 
 
1384 aa  795  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.035759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0360  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.14 
 
 
1374 aa  868  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0319  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.31 
 
 
1368 aa  810  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158483  normal  0.343898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3839  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.45 
 
 
1374 aa  880  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353736  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4756  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.15 
 
 
1357 aa  828  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0477  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50 
 
 
1263 aa  917  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0340  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.39 
 
 
1342 aa  821  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  72.84 
 
 
1183 aa  1202  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.846031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0794  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.95 
 
 
1360 aa  888  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0477  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.21 
 
 
1357 aa  823  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  68.26 
 
 
1238 aa  1628  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  100 
 
 
1177 aa  2401  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4017  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49 
 
 
1376 aa  891  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.563725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2810  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.39 
 
 
1342 aa  820  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102382  normal  0.453839 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0328  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.47 
 
 
1375 aa  845  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.853361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0241  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.41 
 
 
1368 aa  808  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.060417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0189  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.9 
 
 
1343 aa  829  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.76 
 
 
1122 aa  1013  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0481  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  50.25 
 
 
1152 aa  1135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0353  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  41.15 
 
 
1385 aa  699  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.550494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4338  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  63.64 
 
 
1160 aa  1073  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1138  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  56.14 
 
 
1168 aa  1326  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0210  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.67 
 
 
1342 aa  823  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0404668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  86.97 
 
 
1190 aa  2119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1532  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  71.86 
 
 
1126 aa  1195  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.95 
 
 
1149 aa  1061  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613328  normal  0.794281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2072  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.88 
 
 
1363 aa  825  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.244154  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0278  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  71.99 
 
 
1227 aa  1176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00054451  hitchhiker  0.000191986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2719  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  78.62 
 
 
1176 aa  1904  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0714  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  61.01 
 
 
1178 aa  1024  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0122097  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1170  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  58.6 
 
 
1171 aa  962  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0809825  unclonable  1.72992e-07 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0580  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  64.33 
 
 
1170 aa  1048  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0311917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2781  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.22 
 
 
1363 aa  807  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23930  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  62.05 
 
 
1162 aa  1031  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2949  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  50.46 
 
 
1148 aa  1132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29830  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  65.15 
 
 
1170 aa  1058  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896013 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1192  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  62.14 
 
 
1201 aa  1015  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0821  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  49.83 
 
 
1125 aa  1080  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.264809 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5116  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  63.27 
 
 
1155 aa  1069  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0543  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  64.24 
 
 
1155 aa  1090  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174564  normal  0.14479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0753  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  63.05 
 
 
1170 aa  1046  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2667  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  55.71 
 
 
1168 aa  1283  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>