147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0249 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  100 
 
 		 381 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  51.27 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  51.95 
 
 		 386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  49.5 
 
 		 391 aa  332  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  41.96 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  36.84 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  36.97 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  45.83 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  46.98 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  44.59 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  46.23 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  39.92 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  46.23 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  45.5 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  46.51 
 
 		 409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  46.41 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  40.74 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  41.83 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  44.39 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  44.95 
 
 		 484 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  38.57 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  43.54 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  43.16 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  41.75 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  44.23 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  44.23 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  41.24 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  40.09 
 
 		 432 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  39.9 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  36.71 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  41.27 
 
 		 369 aa  149  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  40.98 
 
 		 453 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  38.58 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  42.35 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  39.6 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  38.58 
 
 		 363 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  36.24 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  36.63 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  37.62 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  35.83 
 
 		 380 aa  126  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  36.71 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  33.02 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  37.16 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  39.91 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  36.08 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  38.83 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  33.89 
 
 		 459 aa  99.4  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  33.89 
 
 		 459 aa  97.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 422 aa  95.9  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  32.02 
 
 		 439 aa  93.2  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  32.78 
 
 		 459 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  37.09 
 
 		 486 aa  90.5  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  29.9 
 
 		 433 aa  89.7  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0020  conjugation TrbI-like protein  34.72 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  35.29 
 
 		 447 aa  88.2  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  28.29 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  30.85 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  29.44 
 
 		 466 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  29.69 
 
 		 472 aa  86.7  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  29.1 
 
 		 411 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  29.69 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  29.69 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  28.57 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  26.35 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  30.15 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  29.26 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  28.34 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  29.21 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  29.08 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  28.49 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  28.36 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  29.05 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  31.64 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  26.98 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  31.32 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  32.79 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  28.83 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  28.57 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  34.41 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  31.49 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  28.25 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  28.65 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  32.11 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  29.41 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  27.55 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  33.86 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  29.12 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  24.75 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  28.57 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  27.57 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  29.61 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  28.49 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  28.57 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  27.22 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  28.49 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  27.53 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  27.03 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  28.25 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  28.12 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  28.41 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>