More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3326 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  88.05 
 
 		 450 aa  777    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 453 aa  902    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  56.37 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  50.12 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  49.75 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  48.6 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  47.14 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  41.72 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  44.34 
 
 		 434 aa  355  7.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  44.98 
 
 		 442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.44 
 
 		 450 aa  333  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  42.17 
 
 		 450 aa  332  6e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  39.85 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  38.74 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  37.35 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.24 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  35.36 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  33.5 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 428 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 427 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  32.95 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  33.26 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  32.36 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.04 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  33.59 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  31.67 
 
 		 436 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  29.78 
 
 		 452 aa  180  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.81 
 
 		 438 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  32.07 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  30.25 
 
 		 434 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 460 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 437 aa  153  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  30.85 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 430 aa  128  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 430 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  26.36 
 
 		 430 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  26.36 
 
 		 430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  30.14 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  32.29 
 
 		 429 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.53 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.29 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  28.43 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  33.17 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  25 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0126  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.04 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.36 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  27.3 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.21 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.37 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>