More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2645 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  100 
 
 		 254 aa  497  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  42.08 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  41.95 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  32.16 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  31.66 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  32.84 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.04 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  36.15 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  37.62 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  35.32 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.7 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.39 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  37.83 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  36.95 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.33 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 215 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  34.57 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  31.96 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.9 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35.05 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.33 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 230 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.72 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  32.17 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.77 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.05 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.17 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  35.89 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  33.78 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.25 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  30.19 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.5 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.3 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  33.76 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  32.71 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  31.9 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  35.1 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  35.87 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  34.05 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  34.05 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  37.07 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.38 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 240 aa  92  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.36 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.04 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  32.09 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  33.18 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  34.08 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.82 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6316  GntR domain-containing protein  37.27 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855899  normal  0.236582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  37.27 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  34.06 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6710  GntR domain-containing protein  37.27 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  32.62 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>