More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0368 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
816 aa  1659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.27 
 
 
813 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.57 
 
 
817 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  38.97 
 
 
809 aa  472  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.69 
 
 
823 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  35.19 
 
 
814 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 
807 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.19 
 
 
805 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  37.18 
 
 
796 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.87 
 
 
807 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  34.43 
 
 
797 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.3 
 
 
822 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  34.11 
 
 
821 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  34.72 
 
 
869 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  34.96 
 
 
798 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.39 
 
 
871 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.66 
 
 
805 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.83 
 
 
805 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  35.19 
 
 
803 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  32.94 
 
 
831 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.76 
 
 
882 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  33.86 
 
 
805 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.45 
 
 
821 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  35.92 
 
 
800 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.98 
 
 
808 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  32.93 
 
 
805 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.45 
 
 
809 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.91 
 
 
805 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  31.35 
 
 
802 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  34.51 
 
 
804 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.99 
 
 
878 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.42 
 
 
883 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  30.79 
 
 
804 aa  364  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  32.79 
 
 
845 aa  363  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.87 
 
 
887 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  32.02 
 
 
816 aa  359  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.71 
 
 
855 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  33.53 
 
 
808 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.69 
 
 
862 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  35.02 
 
 
808 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.6 
 
 
913 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  32.36 
 
 
810 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  32.64 
 
 
865 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.91 
 
 
893 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  33.73 
 
 
808 aa  340  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.27 
 
 
844 aa  337  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.33 
 
 
874 aa  336  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.46 
 
 
809 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.01 
 
 
811 aa  333  7.000000000000001e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  34.89 
 
 
819 aa  330  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.17 
 
 
879 aa  330  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  32.57 
 
 
808 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  33.17 
 
 
810 aa  328  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.1 
 
 
817 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  33.41 
 
 
806 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.34 
 
 
810 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.42 
 
 
817 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.92 
 
 
915 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.15 
 
 
849 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.06 
 
 
812 aa  319  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.88 
 
 
919 aa  311  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.02 
 
 
803 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  29.25 
 
 
803 aa  300  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  31.9 
 
 
848 aa  296  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.51 
 
 
819 aa  294  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  31.68 
 
 
835 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.29 
 
 
820 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  30.65 
 
 
843 aa  284  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.71 
 
 
884 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 
809 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.39 
 
 
888 aa  277  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  30.82 
 
 
861 aa  274  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  28.67 
 
 
887 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.42 
 
 
880 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.68 
 
 
844 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.92 
 
 
846 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 
810 aa  257  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
813 aa  251  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  28.13 
 
 
810 aa  246  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.48 
 
 
807 aa  223  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  28.39 
 
 
931 aa  198  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.5 
 
 
828 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 
795 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.97 
 
 
813 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
810 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.25 
 
 
805 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 
788 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 
791 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 
794 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 
801 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 
802 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 
809 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 
794 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 
816 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 
805 aa  137  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
816 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 
807 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 
801 aa  135  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 
805 aa  134  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 
809 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>