More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0694 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  97.93 
 
 		 434 aa  810    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  99.08 
 
 		 434 aa  852    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  100 
 
 		 434 aa  858    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  70.87 
 
 		 437 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  36.81 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  41.69 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  36.05 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  36.36 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.36 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  36.12 
 
 		 427 aa  240  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  37.47 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.62 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  34.29 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.39 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  34.48 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.11 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  37.37 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.39 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  34.98 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  34.64 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.25 
 
 		 438 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.5 
 
 		 415 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  35.47 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.17 
 
 		 407 aa  216  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  30.37 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  30.21 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  35.12 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  34.76 
 
 		 438 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.98 
 
 		 450 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  34.32 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  34.7 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  33.87 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  33.26 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  32.66 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.7 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  34.62 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  30.73 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  33.56 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  32.89 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.79 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  32.35 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  32.47 
 
 		 443 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.44 
 
 		 448 aa  202  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.64 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  32.75 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  33.65 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  32.58 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  34.27 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  34.38 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  30.55 
 
 		 449 aa  199  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  34.77 
 
 		 451 aa  199  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  32.13 
 
 		 443 aa  199  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  32.26 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  33 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.15 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  34.09 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  33.18 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  34.41 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  33.17 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.85 
 
 		 446 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  32.95 
 
 		 435 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  32.21 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  30.91 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  32.07 
 
 		 428 aa  196  8.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 450 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  31.99 
 
 		 427 aa  196  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  34.29 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  33.71 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  32.92 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.09 
 
 		 436 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  33.59 
 
 		 425 aa  192  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  32.07 
 
 		 442 aa  192  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.71 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  32.07 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  32.92 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.41 
 
 		 445 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  32.87 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  31.99 
 
 		 408 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  31.53 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  32.83 
 
 		 424 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  30.18 
 
 		 442 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.57 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  31.55 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31.32 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.81 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.81 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  32.33 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  29.32 
 
 		 403 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  31.95 
 
 		 431 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  31.95 
 
 		 431 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.88 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  32.04 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.88 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  32.42 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  32.88 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  32.42 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  31.72 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  32.11 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>