More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1473 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
574 aa  1133    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
279 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  43.38 
 
 
295 aa  217  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
280 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.24 
 
 
278 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  42.26 
 
 
296 aa  207  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
279 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 
275 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 
279 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.65 
 
 
279 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  43.46 
 
 
279 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  43.58 
 
 
280 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  41.47 
 
 
280 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.47 
 
 
280 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  43.15 
 
 
279 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
280 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
280 aa  193  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000664  putative permease of ABC transporter  41.6 
 
 
262 aa  193  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1030  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  37.6 
 
 
262 aa  186  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21920  putative permease of ABC transporter  42.42 
 
 
265 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1872  ABC transporter permease  42.42 
 
 
265 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
261 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3881  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  42.86 
 
 
265 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0754  ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
259 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.855137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0831  ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
259 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.318596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1603  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.41 
 
 
265 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0185701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.33 
 
 
266 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530706  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
264 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0900077  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
264 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
268 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
261 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
261 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.598666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
264 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  39.85 
 
 
279 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  39.85 
 
 
279 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
264 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1102  ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
259 aa  159  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
293 aa  153  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
297 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  37.55 
 
 
294 aa  147  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
296 aa  146  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  37.5 
 
 
302 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
297 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
312 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
293 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  35.56 
 
 
312 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
299 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  38.58 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
293 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
298 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  36.86 
 
 
293 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.36 
 
 
290 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  34.39 
 
 
330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
293 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
314 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
593 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
278 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
272 aa  107  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.23 
 
 
576 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.77 
 
 
588 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
284 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
334 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
284 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
284 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.28 
 
 
264 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
261 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
271 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
271 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
260 aa  99.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
303 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.28 
 
 
587 aa  97.4  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.51 
 
 
271 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
273 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
287 aa  95.1  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21064  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 
282 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  30.13 
 
 
282 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  30.13 
 
 
282 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
276 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
259 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  0.263608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  30.83 
 
 
271 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
276 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 
294 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 
282 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
259 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 
282 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 
282 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 
282 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
283 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  32.98 
 
 
244 aa  91.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.77 
 
 
551 aa  91.3  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.43 
 
 
281 aa  90.9  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.43 
 
 
281 aa  90.9  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
263 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.65 
 
 
561 aa  89.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 
263 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
258 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.74 
 
 
579 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
258 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>