More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4800 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
579 aa  1142    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.95 
 
 
576 aa  712    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
572 aa  356  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
564 aa  259  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
732 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
544 aa  228  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
551 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
554 aa  189  8e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
602 aa  183  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 
741 aa  179  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
692 aa  179  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 
741 aa  179  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
569 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
728 aa  177  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
543 aa  177  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
563 aa  177  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
741 aa  177  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
740 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
579 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
741 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.81 
 
 
742 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
569 aa  170  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
600 aa  170  5e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  26.8 
 
 
685 aa  170  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
600 aa  170  8e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 
563 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.96 
 
 
587 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
743 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
692 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 
700 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.25 
 
 
692 aa  159  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  26.11 
 
 
556 aa  157  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
561 aa  156  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 
556 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 
692 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.93 
 
 
547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.13 
 
 
559 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  26.1 
 
 
556 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
600 aa  145  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000236655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.91 
 
 
556 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
540 aa  143  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  26.11 
 
 
556 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  26.11 
 
 
556 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 
556 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  25.88 
 
 
556 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  25.88 
 
 
556 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  25.85 
 
 
556 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.36 
 
 
615 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  25.85 
 
 
575 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
557 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  27.23 
 
 
564 aa  133  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.57 
 
 
575 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
541 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.18 
 
 
738 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.6 
 
 
616 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
545 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
634 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.73 
 
 
606 aa  127  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
608 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.35 
 
 
566 aa  123  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.51 
 
 
593 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
543 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27 
 
 
592 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.94 
 
 
589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  27.21 
 
 
589 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.45 
 
 
585 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  25.9 
 
 
585 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.61 
 
 
605 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 
590 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 
585 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
663 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  25.77 
 
 
589 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  26.08 
 
 
590 aa  120  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  25.45 
 
 
568 aa  120  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  25.27 
 
 
585 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28030  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.08 
 
 
578 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  25.81 
 
 
589 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.29 
 
 
590 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 
590 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  25.23 
 
 
583 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  24.73 
 
 
539 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 
585 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.55 
 
 
589 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.29 
 
 
590 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.29 
 
 
590 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  25.41 
 
 
552 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  25.41 
 
 
583 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.15 
 
 
528 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 
590 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.09 
 
 
609 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  25.64 
 
 
583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.4 
 
 
585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.69 
 
 
551 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 
606 aa  114  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>