More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1664 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
271 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  88.93 
 
 
271 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  80.07 
 
 
271 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.13 
 
 
271 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  63.67 
 
 
274 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  63.67 
 
 
274 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  63.67 
 
 
274 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  63.67 
 
 
274 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  63.67 
 
 
274 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  63.67 
 
 
274 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  63.67 
 
 
274 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.1 
 
 
283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  63.3 
 
 
274 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.65 
 
 
274 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  62.03 
 
 
274 aa  307  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.71 
 
 
283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  61.63 
 
 
272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  65.84 
 
 
282 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.21 
 
 
274 aa  298  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  62.16 
 
 
274 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.16 
 
 
274 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.16 
 
 
274 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.16 
 
 
274 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.52 
 
 
267 aa  295  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.39 
 
 
274 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.78 
 
 
274 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.08 
 
 
272 aa  292  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.53 
 
 
274 aa  291  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.83 
 
 
289 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  56.63 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.77 
 
 
274 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.23 
 
 
273 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.51 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
285 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1799  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.68 
 
 
281 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
574 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.62 
 
 
284 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  34.65 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  35.81 
 
 
232 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.83 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
300 aa  95.5  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.07 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1045  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.51 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  32.2 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.3 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0236237  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  32.2 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  32.2 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4343  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.28 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.279119  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  35.29 
 
 
229 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.25 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  35.29 
 
 
228 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  35.29 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.73 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.21 
 
 
230 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.57 
 
 
259 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.67 
 
 
278 aa  92  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.27 
 
 
277 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.27 
 
 
277 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2802  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.98 
 
 
270 aa  92  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.27 
 
 
277 aa  92  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.89 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  39.01 
 
 
279 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  32.46 
 
 
228 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  32.46 
 
 
228 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.05 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.2 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.12 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.38 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1237  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  32.38 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.38 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  30.97 
 
 
229 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.89 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3698  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  36.7 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3654  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.38 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2796  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.38 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2710  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.38 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.66 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  32.38 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3433  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.7 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.38 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2579  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.38 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.21 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
311 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  35.67 
 
 
231 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.21 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  32.16 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03680  sulfate transport protein CysT  31.61 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000172641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0373  sulfate transport protein CysT  31.61 
 
 
272 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.38 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>