More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0766 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  100 
 
 
284 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  97.45 
 
 
277 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  82.78 
 
 
277 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  82.78 
 
 
277 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  82.78 
 
 
277 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3456  sulfate/thiosulfate transporter subunit  82.42 
 
 
277 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.421678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  80.59 
 
 
277 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  80.59 
 
 
277 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0077  sulfate/thiosulfate transporter subunit  73.63 
 
 
276 aa  415  9.999999999999999e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  79.85 
 
 
277 aa  411  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2950  sulfate/thiosulfate transporter subunit  79.85 
 
 
277 aa  408  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.529327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  79.49 
 
 
277 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2579  sulfate/thiosulfate transporter subunit  80.95 
 
 
277 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3654  sulfate/thiosulfate transporter subunit  80.95 
 
 
277 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1237  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  80.22 
 
 
277 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2796  sulfate/thiosulfate transporter subunit  80.22 
 
 
277 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2710  sulfate/thiosulfate transporter subunit  80.22 
 
 
277 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2679  sulfate/thiosulfate transporter subunit  81.41 
 
 
277 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2588  sulfate/thiosulfate transporter subunit  81.41 
 
 
277 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2637  sulfate/thiosulfate transporter subunit  81.41 
 
 
277 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2703  sulfate/thiosulfate transporter subunit  81.41 
 
 
277 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224931  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2809  sulfate/thiosulfate transporter subunit  81.41 
 
 
277 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1065  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  64.68 
 
 
281 aa  314  9e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.83049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0996  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  64.31 
 
 
281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3293  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  64.31 
 
 
281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.249986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1098  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  64.31 
 
 
281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0598734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4317  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  64.75 
 
 
279 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3093  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  65.06 
 
 
281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369613  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0651  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  68.16 
 
 
286 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3013  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  65.06 
 
 
281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0482248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3190  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  64.68 
 
 
281 aa  305  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.467306 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3332  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  59.19 
 
 
296 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845298  normal  0.297479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.85 
 
 
273 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  56.11 
 
 
275 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3600  sulfate ABC transporter, permease protein  65.06 
 
 
281 aa  297  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1004  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  65.43 
 
 
281 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.929522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  55.34 
 
 
275 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1372  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  64.18 
 
 
290 aa  295  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  50.18 
 
 
288 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  50.18 
 
 
288 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  53.44 
 
 
275 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.58 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0611  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  54.04 
 
 
279 aa  285  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0066  sulfate ABC transporter, permease protein  66.91 
 
 
283 aa  285  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3893  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.15 
 
 
278 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.82 
 
 
295 aa  281  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.92 
 
 
291 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1799  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  58.05 
 
 
281 aa  281  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  50.37 
 
 
293 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.69 
 
 
278 aa  278  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.82 
 
 
284 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50 
 
 
308 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.06 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.43 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  50 
 
 
297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.43 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.54 
 
 
318 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3433  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  56.27 
 
 
285 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3698  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  55.89 
 
 
285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1126  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.53 
 
 
275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  45.49 
 
 
288 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.14 
 
 
289 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4740  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.06 
 
 
300 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00816228  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  48.35 
 
 
277 aa  268  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1197  sulfate ABC transporter, permease protein  51.53 
 
 
275 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3692  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  50.37 
 
 
291 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1635  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.06 
 
 
299 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1579  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.06 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1122  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  49.06 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1602  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.06 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  45.66 
 
 
288 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.65 
 
 
278 aa  265  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.76 
 
 
277 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  51.11 
 
 
277 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2015  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  47.62 
 
 
306 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  47.62 
 
 
297 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  47.62 
 
 
297 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.53 
 
 
308 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  50.18 
 
 
279 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  47.62 
 
 
297 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  47.62 
 
 
297 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1862  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  47.25 
 
 
297 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443356  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.08 
 
 
278 aa  263  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  46.72 
 
 
282 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2479  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  47.62 
 
 
306 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1012  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.38 
 
 
275 aa  262  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.63 
 
 
279 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.15 
 
 
278 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0732  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.19 
 
 
274 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5077  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  48.66 
 
 
272 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.38 
 
 
283 aa  259  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  51.6 
 
 
282 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2109  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.81 
 
 
284 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0124  ABC type transporter  50.38 
 
 
278 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000383735 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.38 
 
 
283 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1827  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  48.18 
 
 
280 aa  259  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0309  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  48.66 
 
 
273 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5170  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  48.28 
 
 
272 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451944  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1097  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  48.69 
 
 
284 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4653  sulfate ABC transporter, permease protein  47.78 
 
 
293 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>