More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4317 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4317  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  100 
 
 
279 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0077  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.85 
 
 
276 aa  310  1e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  65.52 
 
 
277 aa  308  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.37 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.75 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  64.37 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.98 
 
 
277 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.6 
 
 
277 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.6 
 
 
277 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2950  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.22 
 
 
277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.529327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.6 
 
 
277 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.6 
 
 
277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.27 
 
 
273 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.27 
 
 
288 aa  295  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3456  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.37 
 
 
277 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.421678 
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  52.27 
 
 
288 aa  295  8e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2809  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.98 
 
 
277 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2637  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.98 
 
 
277 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2703  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.98 
 
 
277 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224931  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2588  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.98 
 
 
277 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2679  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.98 
 
 
277 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3654  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.98 
 
 
277 aa  290  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2579  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.98 
 
 
277 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1237  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  63.6 
 
 
277 aa  288  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2796  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.6 
 
 
277 aa  288  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2710  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.6 
 
 
277 aa  288  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.99 
 
 
291 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1372  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  62.84 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.87 
 
 
293 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.24 
 
 
295 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.87 
 
 
308 aa  284  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0124  ABC type transporter  53.58 
 
 
278 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000383735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.61 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.04 
 
 
297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.96 
 
 
275 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.59 
 
 
275 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  53.01 
 
 
275 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3013  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  60.66 
 
 
281 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0482248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3093  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  60.66 
 
 
281 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369613  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3190  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  60.66 
 
 
281 aa  278  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.467306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1065  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  57.85 
 
 
281 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.83049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.44 
 
 
297 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3293  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  57.47 
 
 
281 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.249986 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.44 
 
 
297 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.44 
 
 
297 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0996  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  57.47 
 
 
281 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.44 
 
 
297 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1122  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.08 
 
 
298 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1579  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.08 
 
 
298 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1602  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.08 
 
 
298 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1098  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  57.47 
 
 
281 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0598734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2015  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.44 
 
 
306 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1862  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.44 
 
 
297 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0651  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  62.76 
 
 
286 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0309  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.89 
 
 
273 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.72 
 
 
299 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.24 
 
 
289 aa  275  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.72 
 
 
299 aa  274  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0083  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.14 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4740  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.36 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00816228  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1635  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.72 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.08 
 
 
276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1544  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.28 
 
 
297 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5230  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.52 
 
 
272 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283699  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  49.63 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1004  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  59.39 
 
 
281 aa  271  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.929522  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5392  sulfate ABC transporter permease protein CysT  50.38 
 
 
285 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0292  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.52 
 
 
272 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.48873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2479  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  50.72 
 
 
306 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.24 
 
 
283 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.24 
 
 
283 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5170  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.14 
 
 
272 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451944  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5077  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.14 
 
 
272 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2075  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.12 
 
 
282 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157073  unclonable  1.0749900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3600  sulfate ABC transporter, permease protein  58.24 
 
 
281 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3893  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.54 
 
 
278 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  50.37 
 
 
282 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  48.31 
 
 
288 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.24 
 
 
282 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.19 
 
 
279 aa  265  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  47.57 
 
 
288 aa  265  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.19 
 
 
284 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.16 
 
 
308 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0066  sulfate ABC transporter, permease protein  61.98 
 
 
283 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03680  sulfate transport protein CysT  51.14 
 
 
272 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000172641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.37 
 
 
278 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0373  sulfate transport protein CysT  50.76 
 
 
272 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1774  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.8 
 
 
300 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0323407  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1045  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  48.28 
 
 
270 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2469  ABC sulfate/thiosulfate transporter, innermembrane subunit, CysT  51.8 
 
 
297 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116692  normal  0.675739 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  46.07 
 
 
285 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  48.88 
 
 
277 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1628  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.72 
 
 
298 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.621307  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2802  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  48.46 
 
 
270 aa  258  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  45.71 
 
 
285 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1126  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  47.6 
 
 
275 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0611  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  50.97 
 
 
279 aa  256  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0557  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  46.4 
 
 
284 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.49996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0732  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.81 
 
 
274 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0593  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  46.04 
 
 
284 aa  255  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>