More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3190 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3190  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  100 
 
 
281 aa  554  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.467306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3013  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  99.29 
 
 
281 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0482248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3093  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  99.29 
 
 
281 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369613  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1065  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  95.02 
 
 
281 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.83049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3293  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  94.66 
 
 
281 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.249986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1098  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  94.66 
 
 
281 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0598734 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0996  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  94.66 
 
 
281 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3600  sulfate ABC transporter, permease protein  96.44 
 
 
281 aa  488  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1004  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  95.02 
 
 
281 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.929522  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0066  sulfate ABC transporter, permease protein  85.56 
 
 
283 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0651  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  77.26 
 
 
286 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1372  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  75.72 
 
 
290 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  66.91 
 
 
277 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  66.91 
 
 
277 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  66.91 
 
 
277 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  66.54 
 
 
277 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2950  sulfate/thiosulfate transporter subunit  66.54 
 
 
277 aa  331  8e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.529327 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0077  sulfate/thiosulfate transporter subunit  61.19 
 
 
276 aa  331  8e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  65.07 
 
 
277 aa  329  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  65.07 
 
 
277 aa  329  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  65.07 
 
 
277 aa  329  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2588  sulfate/thiosulfate transporter subunit  66.18 
 
 
277 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2703  sulfate/thiosulfate transporter subunit  66.18 
 
 
277 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224931  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2637  sulfate/thiosulfate transporter subunit  66.18 
 
 
277 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2679  sulfate/thiosulfate transporter subunit  66.18 
 
 
277 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2809  sulfate/thiosulfate transporter subunit  66.18 
 
 
277 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1237  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  67.28 
 
 
277 aa  324  9e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2796  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.28 
 
 
277 aa  324  9e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2710  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.28 
 
 
277 aa  324  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3654  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.28 
 
 
277 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2579  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.28 
 
 
277 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.28 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3456  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.23 
 
 
277 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.421678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.68 
 
 
284 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  65.06 
 
 
277 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  56.34 
 
 
276 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  58.43 
 
 
295 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  52.04 
 
 
288 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  51.47 
 
 
288 aa  308  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  54.61 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5392  sulfate ABC transporter permease protein CysT  54.55 
 
 
285 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  54.24 
 
 
275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0611  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  56.67 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.44 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  54.15 
 
 
318 aa  301  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1126  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  56.23 
 
 
275 aa  300  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4740  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.7 
 
 
300 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00816228  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  54.35 
 
 
297 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1012  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  55.19 
 
 
275 aa  298  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2479  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  53.28 
 
 
306 aa  298  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0124  ABC type transporter  54.09 
 
 
278 aa  298  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000383735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1635  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.92 
 
 
299 aa  298  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0505  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  56.77 
 
 
278 aa  298  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1862  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  53.28 
 
 
297 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  54.61 
 
 
293 aa  298  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.87 
 
 
291 aa  298  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1197  sulfate ABC transporter, permease protein  55.09 
 
 
275 aa  297  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.92 
 
 
297 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.92 
 
 
297 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.92 
 
 
297 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.92 
 
 
297 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.59 
 
 
299 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2015  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.92 
 
 
306 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.55 
 
 
282 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.22 
 
 
275 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.59 
 
 
299 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1122  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  52.59 
 
 
298 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1579  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.59 
 
 
298 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1602  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.59 
 
 
298 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.78 
 
 
289 aa  295  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3332  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  60.07 
 
 
296 aa  295  8e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845298  normal  0.297479 
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  50.55 
 
 
288 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  50.18 
 
 
288 aa  290  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2259  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.53 
 
 
276 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.550519  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.78 
 
 
283 aa  289  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.19 
 
 
285 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1221  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  58.91 
 
 
304 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  0.19728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.78 
 
 
283 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.02 
 
 
277 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.61 
 
 
284 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.82 
 
 
285 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.79 
 
 
284 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.65 
 
 
278 aa  287  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.9 
 
 
279 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1284  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  59.41 
 
 
304 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0176575  normal  0.203445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3893  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  56.09 
 
 
278 aa  285  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1544  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.48 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  53.82 
 
 
308 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4317  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  59.77 
 
 
279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.05 
 
 
278 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2532  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  50.73 
 
 
282 aa  281  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000130184  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0582  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.29 
 
 
284 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.513137  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  49.82 
 
 
288 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0593  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.29 
 
 
284 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1774  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  52.92 
 
 
300 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0323407  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2469  ABC sulfate/thiosulfate transporter, innermembrane subunit, CysT  53.48 
 
 
297 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116692  normal  0.675739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1799  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  53.65 
 
 
281 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1628  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.82 
 
 
298 aa  279  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.621307  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0557  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  51.29 
 
 
284 aa  279  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.49996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1078  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  54.81 
 
 
281 aa  279  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>