More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1115 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
274 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.91 
 
 
274 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  96.72 
 
 
274 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.99 
 
 
274 aa  507  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.99 
 
 
274 aa  507  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.62 
 
 
274 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.31 
 
 
274 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  84.31 
 
 
274 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  84.31 
 
 
274 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  84.31 
 
 
274 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  84.31 
 
 
274 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  84.31 
 
 
274 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  84.31 
 
 
274 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  84.31 
 
 
274 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  84.31 
 
 
274 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  78.83 
 
 
274 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.56 
 
 
274 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.56 
 
 
274 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.75 
 
 
283 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.01 
 
 
283 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  68.2 
 
 
282 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  63.18 
 
 
271 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  63.6 
 
 
272 aa  301  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.39 
 
 
271 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.47 
 
 
271 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.26 
 
 
271 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.73 
 
 
289 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.37 
 
 
272 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  57.87 
 
 
289 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.75 
 
 
267 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 
274 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.69 
 
 
273 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.82 
 
 
285 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
285 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  36.22 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
276 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
300 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
276 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.24 
 
 
273 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
273 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.75 
 
 
249 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.07 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.2 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  34.12 
 
 
232 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  36.27 
 
 
233 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33 
 
 
259 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.52 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  31.4 
 
 
229 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  35.78 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  30.81 
 
 
229 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
293 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  30.3 
 
 
228 aa  92  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  35.98 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  30.04 
 
 
293 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  34.01 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  29.37 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.58 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  35.98 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  31.4 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  30.96 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4913  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.94 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  29.52 
 
 
269 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.14 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.85 
 
 
230 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  31.75 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.34 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1873  ABC transporter, inner membrane subunit  28.84 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0965334  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  31.75 
 
 
231 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5067  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
307 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517347  normal  0.476874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4791  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 
318 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000398621  hitchhiker  0.00000336758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  36 
 
 
231 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.34 
 
 
278 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  29.22 
 
 
283 aa  89  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  32.62 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  28.99 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3425  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0399054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.22 
 
 
233 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  31.75 
 
 
231 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.81 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  33.16 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  32.8 
 
 
222 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.05 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  35.71 
 
 
227 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.02 
 
 
221 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
281 aa  87  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.85 
 
 
221 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  33.84 
 
 
338 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.4 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.63 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.52 
 
 
226 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>