More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2478 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
235 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.56 
 
 
233 aa  317  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.88 
 
 
226 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.94 
 
 
226 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  64.25 
 
 
238 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.86 
 
 
223 aa  258  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  63.29 
 
 
238 aa  257  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.65 
 
 
227 aa  242  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.81 
 
 
228 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.81 
 
 
228 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  57.89 
 
 
222 aa  230  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.29 
 
 
224 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.89 
 
 
225 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  63.89 
 
 
225 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.89 
 
 
225 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  63.43 
 
 
225 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  63.77 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.35 
 
 
224 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  55.81 
 
 
224 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_003296  RS05467  hypothetical protein  61.26 
 
 
264 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0298  molybdenum ABC transporter, permease protein  64.25 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0329  molybdenum ABC transporter, permease protein  64.25 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1673  molybdenum ABC transporter, permease protein  64.25 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2428  molybdate ABC transporter, permease protein  64.25 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1477  molybdenum ABC transporter, permease protein  64.25 
 
 
224 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304942  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0592  molybdate ABC transporter, permease protein  64.25 
 
 
224 aa  208  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2565  molybdate ABC transporter, permease protein  63.77 
 
 
224 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0868  molybdate ABC transporter, permease protein  63.77 
 
 
224 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.52 
 
 
223 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3756  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.43 
 
 
226 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  54.95 
 
 
222 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  53.47 
 
 
241 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.43 
 
 
226 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4886  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.62 
 
 
225 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186941 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.71 
 
 
224 aa  201  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.7 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.37 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  50 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  56.1 
 
 
233 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  49.77 
 
 
231 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  49.77 
 
 
231 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  49.75 
 
 
225 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
221 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.27 
 
 
221 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  49.77 
 
 
231 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  46.92 
 
 
228 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  46.41 
 
 
229 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  47.2 
 
 
229 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  47.6 
 
 
232 aa  188  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 
221 aa  187  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.66 
 
 
226 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 
221 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 
230 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.52 
 
 
230 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.98 
 
 
221 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  46.7 
 
 
228 aa  184  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.28 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  48.42 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  48.11 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.8 
 
 
230 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.27 
 
 
221 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  45.75 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.15 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.65 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  45.93 
 
 
270 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 
224 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  46.41 
 
 
228 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  46.41 
 
 
228 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  48.23 
 
 
232 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.75 
 
 
615 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  50.72 
 
 
253 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 
244 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
229 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  43.12 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  48.68 
 
 
602 aa  178  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.56 
 
 
628 aa  178  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  42.22 
 
 
224 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 
224 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  45.66 
 
 
240 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
244 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  42.66 
 
 
229 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  48.58 
 
 
227 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
224 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 
224 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  42.2 
 
 
224 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.13 
 
 
229 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
230 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  45.66 
 
 
245 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  45.66 
 
 
240 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.17 
 
 
237 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  43.65 
 
 
224 aa  175  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  45.45 
 
 
230 aa  175  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  45.21 
 
 
240 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  45.22 
 
 
245 aa  174  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  44.35 
 
 
245 aa  174  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  46.07 
 
 
601 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
604 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  45.22 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.15 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>