More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3663 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  100 
 
 		 230 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  68.3 
 
 		 232 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  68 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  69.06 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  64.04 
 
 		 233 aa  277  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.32 
 
 		 230 aa  274  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  63.6 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.78 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  66.37 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.16 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.92 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  66.82 
 
 		 233 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  61.4 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.71 
 
 		 230 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.77 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.6 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.6 
 
 		 244 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.44 
 
 		 237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  61.4 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  64.57 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  55.66 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  55.66 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  57.92 
 
 		 228 aa  244  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  56.11 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  57.47 
 
 		 229 aa  242  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  54.11 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  60.19 
 
 		 228 aa  235  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  60.19 
 
 		 228 aa  235  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  55.2 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  58.37 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  58.37 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  56.95 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  57.47 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.37 
 
 		 229 aa  231  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  57.92 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.56 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  57.92 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  56.95 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  55.16 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  56.95 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  56.95 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  53.78 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  56.5 
 
 		 245 aa  223  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  56.5 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  60.65 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  56.05 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  58.18 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  58.18 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  58.18 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  58.18 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  58.18 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263026 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.09 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  59.09 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  59.09 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  59.09 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  59.09 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  59.09 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  59.09 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  56.5 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  60.27 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  58.64 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  58.99 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  59.91 
 
 		 239 aa  207  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  50.23 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.32 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.44 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  48.64 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.12 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.46 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  56.36 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  45.5 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.11 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0776  ABC-type molybdate transport protein, permease subunit  44.89 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000444846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  43.42 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  47.69 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  46.82 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.12 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2961  molybdenum ABC transporter, permease protein modB  47.53 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  48.4 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  41.82 
 
 		 602 aa  165  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.98 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.38 
 
 		 226 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  44.5 
 
 		 601 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  48.21 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.21 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.21 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  45.5 
 
 		 222 aa  162  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  47.03 
 
 		 270 aa  161  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.69 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.67 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  47.69 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.22 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.95 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.57 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  38.99 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.15 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  45.37 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>