More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3879 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  100 
 
 
233 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  94.42 
 
 
233 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  79.09 
 
 
233 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  71.56 
 
 
232 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.37 
 
 
230 aa  314  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.78 
 
 
230 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.78 
 
 
230 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  65.94 
 
 
231 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  68.14 
 
 
234 aa  294  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.01 
 
 
244 aa  294  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  74.13 
 
 
231 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.25 
 
 
244 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  68.72 
 
 
230 aa  289  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  63.32 
 
 
253 aa  288  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  73.45 
 
 
237 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  71.56 
 
 
244 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  69.33 
 
 
232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  64.04 
 
 
230 aa  277  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  61.33 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  61.78 
 
 
228 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.79 
 
 
230 aa  266  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  66.22 
 
 
233 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  62.22 
 
 
231 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  62.22 
 
 
231 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  57.89 
 
 
232 aa  259  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.78 
 
 
229 aa  257  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  62.22 
 
 
231 aa  257  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.44 
 
 
229 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  56 
 
 
229 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  55.56 
 
 
228 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  59.73 
 
 
230 aa  255  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  62.33 
 
 
228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  62.33 
 
 
228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  61.78 
 
 
229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  56 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  63.72 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  59.56 
 
 
229 aa  243  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.71 
 
 
229 aa  241  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  59.38 
 
 
240 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  241  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  241  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
229 aa  241  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  55.65 
 
 
236 aa  241  9e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
229 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  59.46 
 
 
231 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  60.71 
 
 
243 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  58.93 
 
 
245 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  59.64 
 
 
227 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  59.82 
 
 
245 aa  234  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  59.82 
 
 
245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  59.46 
 
 
240 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  59.01 
 
 
245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  59.38 
 
 
245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  59.01 
 
 
240 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  58.26 
 
 
231 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  61.88 
 
 
239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.65 
 
 
229 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  48.21 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  54 
 
 
228 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.26 
 
 
227 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.98 
 
 
227 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  47.06 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.34 
 
 
223 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.93 
 
 
227 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 
226 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.36 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.91 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.93 
 
 
227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.4 
 
 
227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.17 
 
 
235 aa  164  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  45.45 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.26 
 
 
223 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  45.05 
 
 
228 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  42.59 
 
 
241 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  43.81 
 
 
222 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
222 aa  158  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.27 
 
 
230 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.33 
 
 
228 aa  158  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 
224 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  45.28 
 
 
270 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
221 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
221 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  44.98 
 
 
238 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  46.98 
 
 
225 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 
225 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 
225 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.6 
 
 
227 aa  154  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.24 
 
 
233 aa  154  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.55 
 
 
226 aa  154  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  43.69 
 
 
224 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  43.69 
 
 
224 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  43.69 
 
 
229 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>