More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1555 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  100 
 
 
241 aa  478  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  63.43 
 
 
222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  58.3 
 
 
601 aa  268  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  55.46 
 
 
602 aa  260  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.15 
 
 
604 aa  251  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.15 
 
 
604 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.26 
 
 
628 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.47 
 
 
615 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.52 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.85 
 
 
616 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.77 
 
 
223 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  49.77 
 
 
221 aa  216  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.18 
 
 
227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.3 
 
 
230 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.66 
 
 
226 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.49 
 
 
224 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 
224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  50.25 
 
 
224 aa  201  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  49.75 
 
 
229 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.67 
 
 
221 aa  201  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  49.03 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  49.75 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  49.75 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  49.26 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.43 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
485 aa  197  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103229  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  52.25 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.31 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.47 
 
 
235 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01610  molybdate ABC transporter, permease protein  47.16 
 
 
465 aa  191  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.64 
 
 
224 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  48.54 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.2 
 
 
226 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2345  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.66 
 
 
223 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2303  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.66 
 
 
223 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  48.54 
 
 
238 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03860  molybdate ABC transporter, permease protein  47.35 
 
 
530 aa  188  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.552312 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.77 
 
 
226 aa  186  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.75 
 
 
223 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.51 
 
 
227 aa  184  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.18 
 
 
224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.6 
 
 
221 aa  177  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  47.73 
 
 
224 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1860  molybdenum ABC transporter, permease protein ModB  44.29 
 
 
223 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  50 
 
 
222 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  45.5 
 
 
230 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.36 
 
 
221 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.24 
 
 
220 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.22 
 
 
228 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.22 
 
 
228 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.26 
 
 
225 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.72 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  53.72 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.72 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.26 
 
 
226 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  53.19 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  44.1 
 
 
231 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.21 
 
 
227 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  44.1 
 
 
231 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.08 
 
 
224 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  44 
 
 
228 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  50.27 
 
 
228 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  45.24 
 
 
222 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0244  molybdenum ABC transporter, permease protein  52.56 
 
 
171 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  43.11 
 
 
229 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0202  molybdenum ABC transporter permease  52.56 
 
 
176 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  44.1 
 
 
231 aa  168  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  43.6 
 
 
270 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2341  molybdate ABC transporter, permease protein  40.82 
 
 
218 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.302761  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  42.73 
 
 
229 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  43.84 
 
 
232 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2053  molybdate ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
218 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  44 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  46.45 
 
 
224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.81 
 
 
221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.38 
 
 
221 aa  164  9e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  47.57 
 
 
229 aa  164  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.98 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.24 
 
 
221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 
227 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.6 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  43.81 
 
 
228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.69 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  43.18 
 
 
230 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1442  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 
232 aa  161  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 
221 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.71 
 
 
221 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  45.02 
 
 
232 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  45.74 
 
 
236 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.88 
 
 
229 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
225 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  42.59 
 
 
233 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  44.2 
 
 
228 aa  158  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  41.2 
 
 
233 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0255  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.08 
 
 
229 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0859177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  41.71 
 
 
233 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 
227 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
234 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  48.57 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>