More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0787 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  100 
 
 
229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  98.69 
 
 
229 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  98.69 
 
 
229 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  98.69 
 
 
229 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  98.69 
 
 
229 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  98.69 
 
 
229 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  98.69 
 
 
229 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  95.63 
 
 
229 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  95.63 
 
 
229 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  95.63 
 
 
229 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  95.63 
 
 
229 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  95.63 
 
 
229 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  92.14 
 
 
229 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  76.32 
 
 
229 aa  348  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  75.77 
 
 
228 aa  346  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  78.95 
 
 
229 aa  344  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  75.88 
 
 
231 aa  338  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  75.88 
 
 
231 aa  338  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.19 
 
 
229 aa  337  9e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  75.88 
 
 
231 aa  335  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  76.75 
 
 
229 aa  334  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  70.8 
 
 
229 aa  322  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  69.74 
 
 
232 aa  307  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  71.11 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  70.61 
 
 
245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  65.93 
 
 
228 aa  301  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  72.44 
 
 
245 aa  296  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  72.52 
 
 
245 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  72.52 
 
 
240 aa  294  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  72 
 
 
245 aa  294  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  72.07 
 
 
240 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  71.56 
 
 
245 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  66.36 
 
 
230 aa  291  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  63.72 
 
 
229 aa  291  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  64.32 
 
 
232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  65.33 
 
 
231 aa  271  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.44 
 
 
230 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  59.38 
 
 
233 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  60 
 
 
231 aa  260  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  59.47 
 
 
236 aa  258  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.83 
 
 
234 aa  254  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  60.79 
 
 
233 aa  252  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  57.01 
 
 
228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  59.38 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.56 
 
 
230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.56 
 
 
230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  57.01 
 
 
228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  62.07 
 
 
232 aa  251  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.5 
 
 
244 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  64.14 
 
 
231 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  57.67 
 
 
233 aa  244  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.64 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  59.09 
 
 
230 aa  241  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.71 
 
 
237 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.5 
 
 
244 aa  238  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.06 
 
 
244 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  57.48 
 
 
227 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.31 
 
 
230 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  59.65 
 
 
231 aa  229  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.09 
 
 
229 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  60.44 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  61.43 
 
 
239 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.25 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  56 
 
 
243 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.14 
 
 
227 aa  205  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.89 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  52 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.46 
 
 
223 aa  198  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  55.25 
 
 
228 aa  197  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  48.87 
 
 
228 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.89 
 
 
227 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.58 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  46.7 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 
226 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.66 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  49.09 
 
 
227 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.8 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 
233 aa  174  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.29 
 
 
227 aa  174  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.14 
 
 
235 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  45.5 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  45.5 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0776  ABC-type molybdate transport protein, permease subunit  49.55 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000444846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.85 
 
 
226 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.33 
 
 
224 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.18 
 
 
259 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.02 
 
 
228 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.09 
 
 
230 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.78 
 
 
293 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  47.69 
 
 
233 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  42.86 
 
 
338 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
282 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 
262 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.32 
 
 
221 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.32 
 
 
221 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  46.05 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2961  molybdenum ABC transporter, permease protein modB  46.79 
 
 
227 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>