More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2558 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
293 aa  549  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.25 
 
 
262 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  74.9 
 
 
269 aa  345  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  75.28 
 
 
282 aa  338  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  70.5 
 
 
271 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.32 
 
 
273 aa  329  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.68 
 
 
282 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  71.09 
 
 
259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  76.21 
 
 
282 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  69.2 
 
 
338 aa  295  8e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  66.41 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  53.85 
 
 
267 aa  252  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  62.93 
 
 
287 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  50.86 
 
 
270 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  53.39 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0223679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2905  NifC-like ABC-type porter  53.31 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321959  hitchhiker  0.0000180969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.42 
 
 
286 aa  211  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  51.78 
 
 
269 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  53.91 
 
 
260 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  49.44 
 
 
269 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  53.16 
 
 
293 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1750  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.78 
 
 
278 aa  202  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4508  NifC-like ABC-type porter  57.39 
 
 
269 aa  201  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1852  NifC-like ABC-type porter  48.48 
 
 
272 aa  195  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0537764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  53.03 
 
 
292 aa  195  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  47.37 
 
 
263 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  44.49 
 
 
288 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  45.53 
 
 
287 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  48.84 
 
 
279 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  44.26 
 
 
273 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1068  NifC-like ABC-type porter  53.07 
 
 
255 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  54.17 
 
 
272 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179297  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.72 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  46.73 
 
 
271 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  50.44 
 
 
269 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  50.44 
 
 
269 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  50.44 
 
 
269 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.96 
 
 
263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4176  NifC-like ABC-type porter  57.21 
 
 
267 aa  178  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132481  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  53.04 
 
 
231 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  46.08 
 
 
232 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  47.19 
 
 
264 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2303  NifC-like ABC-type porter  53.88 
 
 
257 aa  175  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  44.55 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3482  NifC-like ABC-type porter  52.43 
 
 
291 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  48.1 
 
 
232 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  45.62 
 
 
230 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  46.77 
 
 
236 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  43.06 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
223 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
228 aa  162  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  43.3 
 
 
229 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  47.62 
 
 
231 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  47.62 
 
 
231 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  35.61 
 
 
278 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  43.84 
 
 
228 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  48.35 
 
 
232 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  43.84 
 
 
228 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  36.55 
 
 
266 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  45.16 
 
 
229 aa  158  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.88 
 
 
229 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  44.24 
 
 
231 aa  158  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  36.97 
 
 
266 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  38.08 
 
 
270 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.57 
 
 
227 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.79 
 
 
230 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  36.55 
 
 
266 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  42.47 
 
 
228 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.38 
 
 
226 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  51.4 
 
 
244 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  49.07 
 
 
228 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4180  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  41.89 
 
 
277 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456448  normal  0.122933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  47.72 
 
 
227 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  37.17 
 
 
266 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  42.58 
 
 
241 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.86 
 
 
234 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3860  sulfate/molybdate ABC transporter inner membrane protein  41.89 
 
 
277 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.384915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.26 
 
 
318 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.96 
 
 
230 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.69 
 
 
297 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.7 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  44.7 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  44.7 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  44.7 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  44.7 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  44.7 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  41.28 
 
 
245 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  42.72 
 
 
233 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.76 
 
 
308 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.07 
 
 
229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  44.98 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  43.19 
 
 
233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  44.24 
 
 
229 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  39.91 
 
 
240 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  44.24 
 
 
229 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  44.24 
 
 
229 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  44.24 
 
 
229 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  44.24 
 
 
229 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.57 
 
 
274 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  46.04 
 
 
238 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>