More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0776 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0776  ABC-type molybdate transport protein, permease subunit  100 
 
 
229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000444846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  66.67 
 
 
229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.9 
 
 
227 aa  278  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.77 
 
 
227 aa  275  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.27 
 
 
227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.44 
 
 
227 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64 
 
 
227 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  59.19 
 
 
228 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  59.19 
 
 
228 aa  257  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  63.56 
 
 
227 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.88 
 
 
228 aa  254  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.71 
 
 
228 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2961  molybdenum ABC transporter, permease protein modB  65.77 
 
 
227 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.78 
 
 
230 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  48.67 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  46.85 
 
 
228 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  47.98 
 
 
230 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  44.89 
 
 
230 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  46.4 
 
 
229 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  48.43 
 
 
232 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.1 
 
 
244 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.64 
 
 
234 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  47.22 
 
 
228 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  47.69 
 
 
229 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  46.82 
 
 
233 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  46.58 
 
 
229 aa  188  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  49.26 
 
 
231 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  49.26 
 
 
231 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.55 
 
 
244 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.66 
 
 
244 aa  184  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  49.26 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.51 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  47.3 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.5 
 
 
229 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.46 
 
 
237 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.85 
 
 
230 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.85 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.95 
 
 
229 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  47.79 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.87 
 
 
230 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  49.55 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  45.91 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  45.91 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  47.3 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  50.23 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  49.77 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  46.15 
 
 
232 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  47.98 
 
 
231 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  44.59 
 
 
233 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  48.48 
 
 
231 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  44.5 
 
 
233 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.51 
 
 
229 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  46.26 
 
 
227 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  44.04 
 
 
233 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  45.58 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  43.95 
 
 
245 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  43.52 
 
 
240 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  43.52 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  43.95 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  43.95 
 
 
245 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  43.06 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  43.84 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.17 
 
 
221 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  44.74 
 
 
602 aa  158  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.66 
 
 
223 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.18 
 
 
223 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.63 
 
 
226 aa  155  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.97 
 
 
226 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  45.83 
 
 
238 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.38 
 
 
628 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.96 
 
 
604 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 
604 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  46.64 
 
 
243 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  45.31 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.47 
 
 
241 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.62 
 
 
221 aa  151  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.99 
 
 
227 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
235 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.08 
 
 
221 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  42.15 
 
 
230 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  43.65 
 
 
601 aa  148  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
233 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  46.31 
 
 
228 aa  148  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
615 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.88 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  50.55 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.48 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  49.48 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>