More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1617 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  96.04 
 
 		 227 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  82.74 
 
 		 227 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75.78 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.65 
 
 		 227 aa  318  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75.11 
 
 		 228 aa  309  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75.11 
 
 		 228 aa  307  8e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  70.8 
 
 		 228 aa  305  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  73.89 
 
 		 227 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  67.86 
 
 		 228 aa  290  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2961  molybdenum ABC transporter, permease protein modB  70.8 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  62.39 
 
 		 229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0776  ABC-type molybdate transport protein, permease subunit  64 
 
 		 229 aa  254  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000444846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  49.56 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  48.25 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  48.02 
 
 		 232 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  48.67 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  47.32 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  46.88 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  46.43 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.23 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  50 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  51.22 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  49.12 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  49.12 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  50 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  46.9 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  48.68 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  50.22 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.03 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  46.46 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  47.81 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.88 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  47.25 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  47.95 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  49.33 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  49.33 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  49.33 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  49.33 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  49.33 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  47.11 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  48.44 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  48.44 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  48.44 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  48.44 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  48.44 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  48.89 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  47.79 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.42 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  45.29 
 
 		 240 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  48.99 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  44.59 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  44.59 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.51 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  42.6 
 
 		 233 aa  167  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  45.95 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  45.95 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  45.5 
 
 		 245 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.24 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  43.75 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  44.64 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  44.64 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  44.64 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.33 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  45.05 
 
 		 227 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  43.78 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.33 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  44.78 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.22 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.32 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  47.12 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  48.85 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.89 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.66 
 
 		 241 aa  154  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  41.84 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.55 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.15 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.97 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  47.62 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.96 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  46.97 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.49 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 		 275 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.56 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>