More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1270 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  97.37 
 
 		 228 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  84.21 
 
 		 231 aa  380  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  84.65 
 
 		 231 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  84.21 
 
 		 231 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  84.72 
 
 		 229 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  84.28 
 
 		 229 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  83.33 
 
 		 229 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  77.19 
 
 		 229 aa  336  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  69.87 
 
 		 229 aa  329  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  76.75 
 
 		 229 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  76.75 
 
 		 229 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  76.75 
 
 		 229 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  76.75 
 
 		 229 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  76.75 
 
 		 229 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  76.32 
 
 		 229 aa  321  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75.88 
 
 		 229 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  75.88 
 
 		 229 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  75.88 
 
 		 229 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  75.88 
 
 		 229 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  75.88 
 
 		 229 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  75.88 
 
 		 229 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  67.98 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  72.44 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  71.56 
 
 		 245 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  72.89 
 
 		 245 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  72.89 
 
 		 245 aa  307  8e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  72.44 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  65.49 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  72.52 
 
 		 245 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  72.07 
 
 		 240 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  63.72 
 
 		 228 aa  297  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  71.62 
 
 		 240 aa  297  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  61.84 
 
 		 230 aa  287  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  61.4 
 
 		 232 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  63.6 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  64.04 
 
 		 231 aa  276  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  60.89 
 
 		 233 aa  274  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  61.33 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  58.59 
 
 		 231 aa  269  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.5 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.56 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.56 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  59.03 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  65.15 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  57.67 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.18 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.95 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  54.15 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  54.15 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  57.89 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.06 
 
 		 244 aa  248  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.62 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.18 
 
 		 237 aa  244  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  57.71 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  57.47 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.67 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  54.39 
 
 		 227 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.95 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  63.82 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  59.19 
 
 		 231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  60 
 
 		 230 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.17 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.46 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.78 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  52.23 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  53.3 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  50.22 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  49.11 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.58 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.79 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 227 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.74 
 
 		 227 aa  187  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.06 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.25 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  47.11 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.41 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.33 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  43.98 
 
 		 338 aa  177  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.72 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  49.07 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  45.93 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  47.77 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.34 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.57 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  44.09 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.65 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.5 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  43.93 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0776  ABC-type molybdate transport protein, permease subunit  46.4 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000444846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  44.29 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.36 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  43.33 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.03 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.03 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>