More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4070 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 227 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  77.27 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.22 
 
 		 226 aa  241  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.94 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.72 
 
 		 227 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  56.54 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  58.22 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  57.48 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.69 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.77 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  59.72 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.81 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  49.29 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.28 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.28 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.68 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  60.68 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.68 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.31 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  59.22 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.17 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.42 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  47.85 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.65 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  45 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  45.5 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.3 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.53 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  43.52 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  45.5 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.61 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  45.5 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.04 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  44.44 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  46.45 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0868  molybdate ABC transporter, permease protein  57.21 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935801  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2565  molybdate ABC transporter, permease protein  57.21 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  45.02 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  45.5 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0298  molybdenum ABC transporter, permease protein  57.21 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1673  molybdenum ABC transporter, permease protein  57.21 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0329  molybdenum ABC transporter, permease protein  57.21 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2428  molybdate ABC transporter, permease protein  57.21 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  45.97 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1477  molybdenum ABC transporter, permease protein  57.21 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  46.08 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  43.44 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0592  molybdate ABC transporter, permease protein  57.21 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  46.54 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4886  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.22 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  44.9 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  46.19 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  44.39 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3756  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.74 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  52.76 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  45.5 
 
 		 602 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  44.9 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  46.39 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.14 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.47 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  42.59 
 
 		 601 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.25 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.15 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_003296  RS05467  hypothetical protein  56.11 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  44.19 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  51.69 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 615 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  43.96 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  44.19 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  43.06 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  43.06 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  44.19 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.07 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.33 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  44.6 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 		 616 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  43.78 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  45.02 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 604 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  46.56 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 604 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.35 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  43.72 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.39 
 
 		 244 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  45.02 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  43.98 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  43.33 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.8 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>