More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4332 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 228 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 228 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  81.98 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  78.38 
 
 		 238 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05467  hypothetical protein  88.16 
 
 		 264 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  81.52 
 
 		 224 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79 
 
 		 225 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  79 
 
 		 225 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79 
 
 		 225 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  78.08 
 
 		 225 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  80.09 
 
 		 224 aa  295  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  78.95 
 
 		 224 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0298  molybdenum ABC transporter, permease protein  79.53 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0329  molybdenum ABC transporter, permease protein  79.53 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2428  molybdate ABC transporter, permease protein  79.53 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1673  molybdenum ABC transporter, permease protein  79.53 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1477  molybdenum ABC transporter, permease protein  79.53 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304942  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4886  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79.45 
 
 		 225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186941 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0868  molybdate ABC transporter, permease protein  79.07 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935801  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2565  molybdate ABC transporter, permease protein  79.07 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0592  molybdate ABC transporter, permease protein  80 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  76.34 
 
 		 226 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.23 
 
 		 227 aa  281  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3756  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75.89 
 
 		 226 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.79 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  66.06 
 
 		 222 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.45 
 
 		 223 aa  254  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.81 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.26 
 
 		 233 aa  245  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.63 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  56.74 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.98 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  47.69 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  51.66 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.65 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.72 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.86 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.24 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.44 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  51.22 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  51.63 
 
 		 602 aa  191  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.39 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.12 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.65 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  48.24 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  48.48 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  48.74 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  47.74 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.24 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  45.25 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  48.48 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  48.48 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.33 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.47 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  48.7 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  47.69 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.97 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  49.01 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  49.01 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  47.17 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  48.09 
 
 		 601 aa  178  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  53.18 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  46.12 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  47.75 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.03 
 
 		 628 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  49.01 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 		 615 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  45.28 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  50.51 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  45.28 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  46.3 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.22 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.22 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.44 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.02 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.44 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.43 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  46.19 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0255  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0859177 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03860  molybdate ABC transporter, permease protein  45.75 
 
 		 530 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.552312 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  44.02 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  46.08 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.52 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  43.06 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  44.02 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  45.71 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.98 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2303  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.63 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2345  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.63 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.19 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.93 
 
 		 485 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  45.19 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  45.25 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.96 
 
 		 604 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  45.25 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01610  molybdate ABC transporter, permease protein  50.56 
 
 		 465 aa  165  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  44.98 
 
 		 228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>