More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05467 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05467  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  88.16 
 
 		 228 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  88.16 
 
 		 228 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  79.28 
 
 		 238 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  78.87 
 
 		 238 aa  340  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  81.99 
 
 		 224 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  80.47 
 
 		 225 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  80.47 
 
 		 225 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  80.47 
 
 		 225 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  80 
 
 		 225 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  80.57 
 
 		 224 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  80.38 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2428  molybdate ABC transporter, permease protein  81.86 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0298  molybdenum ABC transporter, permease protein  81.86 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1673  molybdenum ABC transporter, permease protein  81.86 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1477  molybdenum ABC transporter, permease protein  81.86 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304942  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0329  molybdenum ABC transporter, permease protein  81.86 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2565  molybdate ABC transporter, permease protein  81.86 
 
 		 224 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0868  molybdate ABC transporter, permease protein  81.86 
 
 		 224 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0592  molybdate ABC transporter, permease protein  81.4 
 
 		 224 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3756  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79.55 
 
 		 226 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  71.16 
 
 		 227 aa  285  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4886  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79.73 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79.09 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.79 
 
 		 226 aa  275  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  66.97 
 
 		 222 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.26 
 
 		 235 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.79 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.18 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.95 
 
 		 226 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.72 
 
 		 223 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.67 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  49.31 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.51 
 
 		 221 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 		 221 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  56.74 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  51.43 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  52.36 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.94 
 
 		 226 aa  195  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.52 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.62 
 
 		 223 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.55 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  47.51 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  48.18 
 
 		 224 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.48 
 
 		 221 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  47.03 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  46.58 
 
 		 229 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.22 
 
 		 226 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  46.58 
 
 		 224 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  46.36 
 
 		 224 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  45.91 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  51 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  50.5 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  46.49 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  50 
 
 		 602 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.47 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.98 
 
 		 221 aa  186  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.07 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  51 
 
 		 231 aa  185  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  48.6 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.98 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  49.07 
 
 		 221 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  49.74 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  50.25 
 
 		 228 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  43.58 
 
 		 601 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  49.24 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  44.95 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.06 
 
 		 628 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.9 
 
 		 225 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  56.57 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.78 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.51 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  51.53 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0255  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.04 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0859177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.06 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  46.76 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  44.75 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  44.44 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.12 
 
 		 615 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.22 
 
 		 229 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.73 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.33 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.55 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03860  molybdate ABC transporter, permease protein  46.33 
 
 		 530 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.552312 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  46.67 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.95 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  46.26 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  46.82 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.41 
 
 		 485 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.66 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  45.75 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  45.33 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  45.7 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  46.26 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  43.38 
 
 		 270 aa  165  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>