More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3227 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3756  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  99.56 
 
 		 226 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 226 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  96 
 
 		 225 aa  390  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  95.11 
 
 		 225 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  95.11 
 
 		 225 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  95.11 
 
 		 225 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4886  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  96.89 
 
 		 225 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  80.82 
 
 		 238 aa  343  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  77.17 
 
 		 238 aa  336  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  82.57 
 
 		 224 aa  331  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0868  molybdate ABC transporter, permease protein  88.13 
 
 		 224 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935801  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2565  molybdate ABC transporter, permease protein  88.13 
 
 		 224 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0329  molybdenum ABC transporter, permease protein  87.67 
 
 		 224 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2428  molybdate ABC transporter, permease protein  87.67 
 
 		 224 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0298  molybdenum ABC transporter, permease protein  87.67 
 
 		 224 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1477  molybdenum ABC transporter, permease protein  87.67 
 
 		 224 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1673  molybdenum ABC transporter, permease protein  87.67 
 
 		 224 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0592  molybdate ABC transporter, permease protein  87.21 
 
 		 224 aa  321  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  81.28 
 
 		 224 aa  320  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  81.19 
 
 		 224 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.27 
 
 		 228 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.27 
 
 		 228 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  66.97 
 
 		 222 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05467  hypothetical protein  79.09 
 
 		 264 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.1 
 
 		 226 aa  265  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  67.12 
 
 		 227 aa  264  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.5 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.14 
 
 		 226 aa  238  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.43 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.56 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.6 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.17 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.33 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.87 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  52.58 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  59.33 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.79 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  46.54 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.8 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  58.88 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.19 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  46.43 
 
 		 602 aa  188  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  52.06 
 
 		 241 aa  187  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.95 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.72 
 
 		 221 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  46.33 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  46.33 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.19 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  48.37 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  47.24 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  45.81 
 
 		 601 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  46.51 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  46.51 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  48.72 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.95 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  47.95 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  51.5 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  42.86 
 
 		 229 aa  178  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  44.95 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  46.7 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  46.51 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.74 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  43.75 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  44.75 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.3 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.53 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.6 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  44.29 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  44.29 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  44.09 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  43.84 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  46.73 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  46.33 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  48.68 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.78 
 
 		 628 aa  171  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.27 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.89 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.4 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.18 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.14 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  45.33 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.14 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.64 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  44.44 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  47 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.05 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.14 
 
 		 615 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  44.84 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  44.84 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  48.58 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  47.64 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.36 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.4 
 
 		 604 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>