More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0570 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  100 
 
 
238 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  88.41 
 
 
238 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  78.38 
 
 
228 aa  324  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  78.38 
 
 
228 aa  324  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79.63 
 
 
224 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  78.18 
 
 
225 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  78.18 
 
 
225 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  78.18 
 
 
225 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  78.18 
 
 
225 aa  318  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79.17 
 
 
224 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  79.17 
 
 
224 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1673  molybdenum ABC transporter, permease protein  80.82 
 
 
224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1477  molybdenum ABC transporter, permease protein  80.82 
 
 
224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0298  molybdenum ABC transporter, permease protein  80.82 
 
 
224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0868  molybdate ABC transporter, permease protein  80.37 
 
 
224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935801  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2428  molybdate ABC transporter, permease protein  80.82 
 
 
224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0329  molybdenum ABC transporter, permease protein  80.82 
 
 
224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2565  molybdate ABC transporter, permease protein  80.37 
 
 
224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4886  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  78.18 
 
 
225 aa  294  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0592  molybdate ABC transporter, permease protein  78.54 
 
 
224 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.17 
 
 
226 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3756  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  76.71 
 
 
226 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_003296  RS05467  hypothetical protein  78.87 
 
 
264 aa  276  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  66.98 
 
 
222 aa  271  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  66.67 
 
 
227 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.11 
 
 
226 aa  264  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.29 
 
 
235 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.99 
 
 
223 aa  245  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.54 
 
 
233 aa  241  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.37 
 
 
226 aa  234  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  46.76 
 
 
225 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.55 
 
 
227 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 
221 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  58.29 
 
 
224 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.24 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.52 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  49.76 
 
 
222 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
221 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.03 
 
 
227 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  50.8 
 
 
602 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.45 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.47 
 
 
221 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  42.92 
 
 
601 aa  185  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 
226 aa  185  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 
221 aa  184  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.47 
 
 
221 aa  184  9e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  48.24 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  45.65 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  50.27 
 
 
221 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.6 
 
 
223 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  45.58 
 
 
227 aa  177  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  44.6 
 
 
224 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  44.6 
 
 
224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  44.6 
 
 
224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  44.6 
 
 
229 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  45.33 
 
 
224 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.94 
 
 
225 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.6 
 
 
224 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  46.31 
 
 
224 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.45 
 
 
230 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  47.31 
 
 
232 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  44.13 
 
 
224 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  53.81 
 
 
233 aa  175  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.03 
 
 
230 aa  174  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  43.42 
 
 
230 aa  174  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  44.35 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.58 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 
628 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  46.84 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  46.84 
 
 
231 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.94 
 
 
615 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.21 
 
 
230 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  43.81 
 
 
228 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  43.33 
 
 
229 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
230 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  46.84 
 
 
231 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  50.56 
 
 
231 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  44.5 
 
 
230 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  42.72 
 
 
229 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.31 
 
 
229 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.74 
 
 
230 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  42.2 
 
 
228 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  47.98 
 
 
232 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.88 
 
 
224 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.85 
 
 
229 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2345  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2303  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  43.08 
 
 
229 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0255  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.24 
 
 
229 aa  166  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0859177 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.59 
 
 
221 aa  165  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.72 
 
 
604 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.72 
 
 
604 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  46.08 
 
 
228 aa  164  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  46.08 
 
 
228 aa  164  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  44.14 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.59 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>