More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2849 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  99.57 
 
 
231 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  100 
 
 
231 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  99.13 
 
 
231 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  84.65 
 
 
229 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  84.58 
 
 
228 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  86.84 
 
 
229 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  84.28 
 
 
229 aa  362  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  83.41 
 
 
229 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  77.63 
 
 
229 aa  341  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  71.37 
 
 
229 aa  333  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  77.19 
 
 
229 aa  330  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  77.19 
 
 
229 aa  330  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  77.19 
 
 
229 aa  330  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  77.19 
 
 
229 aa  330  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  77.19 
 
 
229 aa  330  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  76.32 
 
 
229 aa  324  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  76.32 
 
 
229 aa  324  7e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  76.32 
 
 
229 aa  324  7e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  76.32 
 
 
229 aa  324  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  76.32 
 
 
229 aa  324  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  76.32 
 
 
229 aa  324  7e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  75.88 
 
 
229 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  68.42 
 
 
232 aa  318  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  70 
 
 
240 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  70 
 
 
245 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  70 
 
 
245 aa  307  9e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  70 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  69.57 
 
 
245 aa  305  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  70.04 
 
 
245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  66.08 
 
 
229 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  65.2 
 
 
228 aa  304  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  69.6 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  69.16 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  62.73 
 
 
230 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  61.95 
 
 
232 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  65.04 
 
 
236 aa  275  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  61.5 
 
 
231 aa  274  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  62.22 
 
 
233 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  61.33 
 
 
233 aa  266  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  58.22 
 
 
231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.23 
 
 
230 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.67 
 
 
230 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.67 
 
 
230 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  65.15 
 
 
231 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.35 
 
 
244 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  58.6 
 
 
233 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  56.89 
 
 
253 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  55.66 
 
 
228 aa  248  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  55.66 
 
 
228 aa  248  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  58.37 
 
 
230 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.35 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  56.83 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.79 
 
 
237 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.35 
 
 
244 aa  242  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.27 
 
 
230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.3 
 
 
234 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  65.83 
 
 
239 aa  235  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  57.55 
 
 
227 aa  234  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.46 
 
 
230 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  59.63 
 
 
231 aa  229  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.56 
 
 
229 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  55.11 
 
 
232 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  58.22 
 
 
230 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.91 
 
 
227 aa  214  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  55.36 
 
 
243 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  54.39 
 
 
228 aa  204  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  52.05 
 
 
228 aa  201  9e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
227 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.26 
 
 
223 aa  198  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  51.54 
 
 
229 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.12 
 
 
223 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.78 
 
 
227 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
235 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.3 
 
 
227 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.12 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.91 
 
 
227 aa  185  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  47.6 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.28 
 
 
226 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.21 
 
 
227 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  45.93 
 
 
238 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.44 
 
 
221 aa  177  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  45.24 
 
 
222 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
221 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  48.66 
 
 
227 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  45.85 
 
 
338 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.49 
 
 
228 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.28 
 
 
228 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.89 
 
 
224 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.57 
 
 
224 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.75 
 
 
262 aa  175  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  45.58 
 
 
224 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  44.5 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.73 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  49.77 
 
 
233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.35 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.44 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  47.44 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>