More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3714 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  100 
 
 		 228 aa  427  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  59.01 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  55.07 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  59.45 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  59.45 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  54.19 
 
 		 229 aa  241  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  54.63 
 
 		 228 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  53.95 
 
 		 228 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  54.87 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  52.19 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  57.27 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  54.39 
 
 		 231 aa  234  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  54.39 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  54.39 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  55.2 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.39 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.28 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.73 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  58.06 
 
 		 227 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  53.18 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  57.52 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  54.17 
 
 		 245 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  56.36 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  56.74 
 
 		 233 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.21 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.74 
 
 		 229 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  56.62 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  56.62 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  56.62 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  56.62 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  56.62 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  54.55 
 
 		 245 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.76 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  54.17 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  54.79 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  54.09 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.64 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  53.64 
 
 		 245 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  55.25 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  53.18 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  56.16 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  53.7 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  59.09 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  59.91 
 
 		 243 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.85 
 
 		 244 aa  214  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  59.01 
 
 		 244 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  52.09 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  64.14 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.79 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  54.79 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  54.79 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  54.79 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  55.25 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  51.58 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  54.79 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  50.22 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  58.96 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  54.79 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.1 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.63 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  60 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.39 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  55.15 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.87 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  45 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  55.91 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.65 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  45.33 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.49 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.64 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.07 
 
 		 293 aa  177  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.71 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  48.37 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.44 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  47.47 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.89 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  46.12 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.4 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.17 
 
 		 271 aa  171  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  41.86 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  41.28 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  48.11 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.18 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.12 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.25 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  40.37 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.18 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  40.37 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  40.37 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  39.91 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.76 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  46.26 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.24 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  43.78 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>