More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0213 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  100 
 
 
239 aa  448  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  76.44 
 
 
231 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  62.27 
 
 
229 aa  271  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  62.27 
 
 
228 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  63.27 
 
 
231 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  67.42 
 
 
230 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  62.78 
 
 
232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  61.19 
 
 
229 aa  264  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.27 
 
 
234 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  63.64 
 
 
231 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  63.18 
 
 
231 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  62.73 
 
 
233 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  63.72 
 
 
233 aa  258  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.41 
 
 
229 aa  257  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  62.9 
 
 
228 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  62.9 
 
 
228 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  62.73 
 
 
231 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.9 
 
 
230 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  61.82 
 
 
233 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.44 
 
 
230 aa  255  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  62.61 
 
 
253 aa  251  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  63.51 
 
 
233 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  59.82 
 
 
232 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  58.04 
 
 
230 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  56.76 
 
 
229 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  62.73 
 
 
229 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  57.01 
 
 
228 aa  248  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  59.91 
 
 
230 aa  247  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  63.72 
 
 
229 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.46 
 
 
229 aa  245  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.57 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  59.13 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  64.19 
 
 
227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  62.78 
 
 
229 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  62.78 
 
 
229 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  62.78 
 
 
229 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  62.78 
 
 
229 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  62.78 
 
 
229 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  61.26 
 
 
231 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.91 
 
 
244 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  63.08 
 
 
231 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.3 
 
 
244 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.47 
 
 
237 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  60.87 
 
 
245 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  60.87 
 
 
245 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  60.43 
 
 
245 aa  238  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  61.61 
 
 
245 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
245 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  61.43 
 
 
232 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
240 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.43 
 
 
229 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  61.43 
 
 
229 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  61.43 
 
 
229 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  61.43 
 
 
229 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  61.43 
 
 
229 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  61.43 
 
 
229 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  61.43 
 
 
229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  55 
 
 
236 aa  228  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.4 
 
 
230 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.91 
 
 
230 aa  225  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  63.96 
 
 
230 aa  222  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  63.01 
 
 
243 aa  221  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.49 
 
 
229 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  63.73 
 
 
228 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  46.36 
 
 
228 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 
227 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.47 
 
 
262 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.48 
 
 
223 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  47.49 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  45.41 
 
 
228 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
259 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
227 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.83 
 
 
227 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.12 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 
226 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  49.01 
 
 
269 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.73 
 
 
293 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.75 
 
 
227 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.29 
 
 
228 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.13 
 
 
282 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.61 
 
 
226 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.34 
 
 
235 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.68 
 
 
230 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.12 
 
 
233 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.86 
 
 
223 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.71 
 
 
227 aa  158  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.73 
 
 
227 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.29 
 
 
228 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
241 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.31 
 
 
273 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.69 
 
 
226 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2961  molybdenum ABC transporter, permease protein modB  45.7 
 
 
227 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.66 
 
 
227 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  48.56 
 
 
282 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.44 
 
 
221 aa  151  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  42.86 
 
 
222 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  43.97 
 
 
238 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>