More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0972 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  100 
 
 		 231 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  73.42 
 
 		 233 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  72.07 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  68.83 
 
 		 232 aa  309  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  68.7 
 
 		 230 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  71.76 
 
 		 233 aa  301  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  68.26 
 
 		 230 aa  300  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.67 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.67 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  70.22 
 
 		 230 aa  295  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  64.94 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.22 
 
 		 237 aa  291  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  63.44 
 
 		 229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  63.44 
 
 		 228 aa  280  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  70.22 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.83 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  61.23 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  63.2 
 
 		 253 aa  277  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.2 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  65.37 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  64.57 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  59.91 
 
 		 229 aa  268  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  66.96 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.95 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  62.22 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  62.22 
 
 		 231 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  57.01 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  64.79 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  64.79 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  62.22 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  62.22 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  59.11 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.79 
 
 		 229 aa  256  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.35 
 
 		 229 aa  255  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  56.11 
 
 		 228 aa  254  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  54.11 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  61.78 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  63.98 
 
 		 227 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.64 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  61.64 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  61.64 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  62.1 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  61.64 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  61.64 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  61.64 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  62.1 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  62.1 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  62.1 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  62.1 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  62.1 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  56.39 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  62.5 
 
 		 230 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  57.52 
 
 		 245 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  55.75 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  57.52 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  57.08 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  59.73 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  56.31 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  55.86 
 
 		 245 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  55.86 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  62.73 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  57.85 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.85 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  62.33 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  49.32 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  50.88 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.98 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  49.08 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  53.46 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.11 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.22 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.11 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.95 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.98 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.87 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  48.06 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.2 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  49.33 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.35 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.87 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.77 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.87 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.13 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.9 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.34 
 
 		 262 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.72 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  47.09 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  46.76 
 
 		 338 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  46.58 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.55 
 
 		 282 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.92 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.28 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.23 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  48.82 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  44.13 
 
 		 270 aa  159  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0776  ABC-type molybdate transport protein, permease subunit  47.75 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000444846  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.29 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  49.29 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.29 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>