More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3985 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  100 
 
 		 338 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  68.09 
 
 		 262 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.2 
 
 		 293 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.08 
 
 		 271 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  64 
 
 		 269 aa  315  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.07 
 
 		 282 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  65.6 
 
 		 282 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.9 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  70.93 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  67.45 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.87 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  56.82 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  58.61 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  52.36 
 
 		 269 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  53.71 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.15 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2905  NifC-like ABC-type porter  56.19 
 
 		 275 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321959  hitchhiker  0.0000180969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  51 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  48.71 
 
 		 270 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1852  NifC-like ABC-type porter  53.23 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0537764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  56.19 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  53.04 
 
 		 256 aa  203  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0223679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1750  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  66.23 
 
 		 278 aa  199  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  44.4 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4508  NifC-like ABC-type porter  54.08 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  44.06 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1068  NifC-like ABC-type porter  54.91 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  57.21 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.84 
 
 		 263 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  43.98 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  43.52 
 
 		 228 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4176  NifC-like ABC-type porter  58.62 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  45.85 
 
 		 231 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  45.85 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  45.34 
 
 		 263 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  53.94 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  45.41 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  43.4 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  40.93 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  48.11 
 
 		 232 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.76 
 
 		 229 aa  175  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.17 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  50.85 
 
 		 231 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  43.12 
 
 		 229 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2303  NifC-like ABC-type porter  53.64 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.47 
 
 		 229 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  49.12 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  43.93 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  49.12 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  49.12 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  45.05 
 
 		 230 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3482  NifC-like ABC-type porter  53.4 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  48.88 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  42.47 
 
 		 229 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  42.99 
 
 		 232 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.41 
 
 		 223 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  41.03 
 
 		 228 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  44.2 
 
 		 229 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  44.2 
 
 		 229 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  44.2 
 
 		 229 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  44.2 
 
 		 229 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  44.2 
 
 		 229 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  44.78 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  42.99 
 
 		 229 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  43.58 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  44.29 
 
 		 229 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  41.28 
 
 		 245 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 		 229 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  43.75 
 
 		 229 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  43.75 
 
 		 229 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  43.75 
 
 		 229 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  43.75 
 
 		 229 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  43.75 
 
 		 229 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.74 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  44.28 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  46.45 
 
 		 231 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  40.18 
 
 		 240 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3756  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.08 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  45.36 
 
 		 236 aa  155  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  42.86 
 
 		 229 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  41.63 
 
 		 240 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4180  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  41.67 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456448  normal  0.122933 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.99 
 
 		 224 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3860  sulfate/molybdate ABC transporter inner membrane protein  41.67 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.384915  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  41.15 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0793  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  40.25 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4088  polysaccharide export protein  43.81 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  40.09 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  40.09 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  40.09 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  38.59 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  40.83 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  40.83 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  41.15 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 226 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  45.12 
 
 		 238 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  44.28 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>