More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4508 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4508  NifC-like ABC-type porter  100 
 
 
269 aa  514  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  57.77 
 
 
269 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  62.39 
 
 
269 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  62.39 
 
 
269 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  62.39 
 
 
269 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  61.35 
 
 
256 aa  247  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0223679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  57.37 
 
 
269 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  59.43 
 
 
293 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56 
 
 
293 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2905  NifC-like ABC-type porter  60.78 
 
 
275 aa  238  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321959  hitchhiker  0.0000180969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  60.18 
 
 
264 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  55.16 
 
 
269 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1852  NifC-like ABC-type porter  54.55 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0537764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.55 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.99 
 
 
262 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.7 
 
 
282 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.09 
 
 
286 aa  221  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.19 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  59.83 
 
 
292 aa  214  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1068  NifC-like ABC-type porter  59.73 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  49.58 
 
 
267 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  56.19 
 
 
338 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.65 
 
 
259 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2303  NifC-like ABC-type porter  59.73 
 
 
257 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.96 
 
 
282 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3482  NifC-like ABC-type porter  61.27 
 
 
291 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  51.35 
 
 
282 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4176  NifC-like ABC-type porter  59 
 
 
267 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  45.15 
 
 
270 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.42 
 
 
315 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  56.19 
 
 
272 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179297  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  51.89 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  50.42 
 
 
260 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  43.64 
 
 
287 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  45.53 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  43.35 
 
 
288 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  41.08 
 
 
273 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  43.5 
 
 
271 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  41.57 
 
 
263 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1750  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.8 
 
 
278 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.88 
 
 
263 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  33.6 
 
 
278 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.92 
 
 
274 aa  144  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  47.31 
 
 
231 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
241 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  46.77 
 
 
231 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  33.07 
 
 
266 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  32.67 
 
 
266 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 
275 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  32.67 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.18 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  46.24 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  41.7 
 
 
232 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
292 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.63 
 
 
227 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
230 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  40.27 
 
 
228 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  39.11 
 
 
229 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  43.89 
 
 
230 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 
222 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  45.9 
 
 
232 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  38.89 
 
 
224 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
224 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  38.38 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  40.18 
 
 
228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  38.38 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02517  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  36.67 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  40.91 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.78 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  40.62 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  37.88 
 
 
224 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  36.94 
 
 
279 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  48.59 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.41 
 
 
628 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  40.99 
 
 
231 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.89 
 
 
244 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
223 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.52 
 
 
244 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  37.55 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  45.36 
 
 
231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4306  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.35 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.89 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.36 
 
 
229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.33 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  46.04 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.5 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  45.59 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  37.56 
 
 
601 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  39.34 
 
 
229 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  37.38 
 
 
237 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  38.35 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.35 
 
 
285 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>