More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1068 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1068  NifC-like ABC-type porter  100 
 
 
255 aa  480  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  73.36 
 
 
269 aa  322  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  71.71 
 
 
269 aa  318  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  76.82 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2905  NifC-like ABC-type porter  72.69 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321959  hitchhiker  0.0000180969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  70.68 
 
 
256 aa  301  8.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0223679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  68.28 
 
 
269 aa  274  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  68.28 
 
 
269 aa  274  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  68.28 
 
 
269 aa  274  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  73.57 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3482  NifC-like ABC-type porter  75.77 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  68.28 
 
 
264 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1852  NifC-like ABC-type porter  56 
 
 
272 aa  251  9.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0537764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.4 
 
 
262 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4176  NifC-like ABC-type porter  68.72 
 
 
267 aa  242  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132481  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.03 
 
 
293 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2303  NifC-like ABC-type porter  63.56 
 
 
257 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.15 
 
 
259 aa  235  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  52.02 
 
 
269 aa  232  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.08 
 
 
282 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.86 
 
 
286 aa  227  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.48 
 
 
271 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4508  NifC-like ABC-type porter  58.87 
 
 
269 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  62.72 
 
 
272 aa  222  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179297  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  55.19 
 
 
338 aa  219  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.32 
 
 
273 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.25 
 
 
315 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  48.9 
 
 
270 aa  207  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.44 
 
 
282 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  48.7 
 
 
267 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  52.8 
 
 
282 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  46.38 
 
 
279 aa  185  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  50.94 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  51.66 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.67 
 
 
263 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  42.98 
 
 
288 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  41 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  43.67 
 
 
263 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.44 
 
 
275 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  45.63 
 
 
271 aa  162  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.41 
 
 
292 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  40.43 
 
 
287 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  45.15 
 
 
231 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  44.66 
 
 
231 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  45.15 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  40.53 
 
 
229 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  35.74 
 
 
266 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  41.78 
 
 
229 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1750  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.61 
 
 
278 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  44.39 
 
 
232 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  46.94 
 
 
232 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  34.89 
 
 
266 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  37.39 
 
 
278 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  42.34 
 
 
228 aa  148  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4306  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.01 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.2 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  34.47 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  49.07 
 
 
244 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  40.85 
 
 
270 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  42.44 
 
 
228 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.96 
 
 
230 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44 
 
 
230 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.96 
 
 
230 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.17 
 
 
244 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.17 
 
 
244 aa  141  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  35.42 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  42.79 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  42.35 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  37.79 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.21 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.77 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.29 
 
 
224 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.66 
 
 
244 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  44.49 
 
 
229 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  40 
 
 
241 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  44.92 
 
 
231 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  40.98 
 
 
233 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  42.41 
 
 
231 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.5 
 
 
230 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  43.56 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  44.39 
 
 
232 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  40.98 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0732  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  37.5 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  33.91 
 
 
288 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0309  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  36.68 
 
 
273 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
229 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0083  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.68 
 
 
273 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
233 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.91 
 
 
288 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0793  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  38.5 
 
 
279 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  42.29 
 
 
230 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2328  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  39.46 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000348346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4653  sulfate ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  35.59 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.51 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03680  sulfate transport protein CysT  36.24 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000172641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3873  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  39.07 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.204437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>