More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1852 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1852  NifC-like ABC-type porter  100 
 
 
272 aa  517  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0537764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  57.58 
 
 
269 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  57.68 
 
 
269 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  59.13 
 
 
293 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2905  NifC-like ABC-type porter  58.16 
 
 
275 aa  238  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321959  hitchhiker  0.0000180969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  57.63 
 
 
256 aa  235  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0223679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  58.89 
 
 
292 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  55.04 
 
 
269 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  55.04 
 
 
269 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  55.04 
 
 
269 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  56.83 
 
 
264 aa  225  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1068  NifC-like ABC-type porter  58.04 
 
 
255 aa  221  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  51 
 
 
269 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.1 
 
 
262 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  52.36 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.59 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3482  NifC-like ABC-type porter  59.47 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4508  NifC-like ABC-type porter  56.33 
 
 
269 aa  212  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2303  NifC-like ABC-type porter  57.71 
 
 
257 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.42 
 
 
271 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.45 
 
 
286 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4176  NifC-like ABC-type porter  59.82 
 
 
267 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132481  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  53.23 
 
 
338 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  55.27 
 
 
272 aa  201  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179297  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.92 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.91 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.51 
 
 
259 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.05 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  48.44 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  47.64 
 
 
287 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.1 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  46.18 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  47.39 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  46.97 
 
 
271 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  40.53 
 
 
279 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  41.45 
 
 
288 aa  149  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  37.6 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  41.2 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  31.75 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  41.85 
 
 
263 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.93 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.2 
 
 
275 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  42.11 
 
 
229 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4306  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.6 
 
 
272 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1750  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.22 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  40.78 
 
 
232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.61 
 
 
274 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
223 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.33 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.33 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.7 
 
 
230 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  40.29 
 
 
228 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.06 
 
 
224 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.2 
 
 
244 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  38.28 
 
 
229 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.65 
 
 
227 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  38.35 
 
 
228 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  36.76 
 
 
602 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  38.05 
 
 
231 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  38.05 
 
 
231 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.93 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  36.67 
 
 
237 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.93 
 
 
285 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  34.58 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  38.05 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  41.62 
 
 
238 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  35.29 
 
 
265 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
244 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.19 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  37.98 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4653  sulfate ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.77 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  38.35 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  32.13 
 
 
288 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.13 
 
 
288 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4088  polysaccharide export protein  37.21 
 
 
279 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101815 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
222 aa  115  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 
288 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  34.65 
 
 
601 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.68 
 
 
263 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3756  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  36.74 
 
 
277 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0083  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.63 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  35.68 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  31 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  42.21 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5392  sulfate ABC transporter permease protein CysT  31.8 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.19 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0732  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.13 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0309  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.63 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3401  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  36.1 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.61 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  30.57 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  36.17 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  36 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0077  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.66 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>