More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2303 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2303  NifC-like ABC-type porter  100 
 
 
257 aa  474  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  65.45 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  64.03 
 
 
269 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  66.38 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  66.38 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  66.38 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  63.31 
 
 
256 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0223679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  66.09 
 
 
293 aa  251  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  64.19 
 
 
264 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2905  NifC-like ABC-type porter  61.57 
 
 
275 aa  237  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321959  hitchhiker  0.0000180969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1068  NifC-like ABC-type porter  64 
 
 
255 aa  237  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.26 
 
 
262 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1852  NifC-like ABC-type porter  57.85 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0537764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  57.14 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  66.41 
 
 
292 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3482  NifC-like ABC-type porter  65.8 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.8 
 
 
286 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.47 
 
 
271 aa  218  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  50.4 
 
 
267 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4508  NifC-like ABC-type porter  59.57 
 
 
269 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.23 
 
 
293 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.44 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4176  NifC-like ABC-type porter  63.76 
 
 
267 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132481  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.75 
 
 
273 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  52.87 
 
 
338 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.01 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
272 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179297  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  54.8 
 
 
282 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  52.36 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.02 
 
 
315 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.39 
 
 
282 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  51.17 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  44.35 
 
 
270 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  43.22 
 
 
263 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.58 
 
 
263 aa  158  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1750  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60 
 
 
278 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  41.15 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  39.57 
 
 
273 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  41.28 
 
 
279 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.3 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  35.59 
 
 
278 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  40.79 
 
 
288 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  43.69 
 
 
231 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  43.2 
 
 
231 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  42.72 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.09 
 
 
244 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  39.07 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
274 aa  132  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  41.87 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  41.26 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.55 
 
 
230 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  45.36 
 
 
232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.06 
 
 
230 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12426  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysW  37.4 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0014023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.2 
 
 
244 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  43.78 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  43.41 
 
 
230 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  43.82 
 
 
229 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2680  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  38.46 
 
 
272 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  0.445227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  43.98 
 
 
231 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  40.98 
 
 
233 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  33.48 
 
 
266 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4306  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.8 
 
 
272 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
224 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  40 
 
 
231 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
233 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
241 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  35.56 
 
 
270 aa  123  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  33.48 
 
 
266 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
223 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3873  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  36.8 
 
 
270 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.204437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 
292 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.22 
 
 
229 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.64 
 
 
244 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4912  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
269 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
232 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0124  ABC type transporter  36.18 
 
 
278 aa  121  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000383735 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2328  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  41.56 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000348346  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  33.48 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.87 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2778  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  41.75 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  40.87 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0373  sulfate transport protein CysT  37.55 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03680  sulfate transport protein CysT  37.12 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000172641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  41.24 
 
 
224 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  42.31 
 
 
232 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  36.87 
 
 
229 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  41.24 
 
 
224 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  36.03 
 
 
282 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  40 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  32.54 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.55 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  38.16 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  40.98 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  41.24 
 
 
224 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
224 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  40.68 
 
 
224 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>