More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1949 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
259 aa  480  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  73.73 
 
 
262 aa  358  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  71.98 
 
 
269 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  70.75 
 
 
271 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  71.03 
 
 
293 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.68 
 
 
282 aa  332  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  75.49 
 
 
282 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  67.57 
 
 
273 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75.55 
 
 
282 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  68.27 
 
 
338 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  66.41 
 
 
315 aa  258  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  57.49 
 
 
267 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  61.37 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  57.87 
 
 
260 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  54.76 
 
 
269 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  56.96 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.89 
 
 
286 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  48.05 
 
 
270 aa  208  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1750  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  66.08 
 
 
278 aa  205  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1068  NifC-like ABC-type porter  57.27 
 
 
255 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  51.63 
 
 
256 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0223679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2905  NifC-like ABC-type porter  53.12 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321959  hitchhiker  0.0000180969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  54.87 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  58.74 
 
 
292 aa  195  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4508  NifC-like ABC-type porter  53.91 
 
 
269 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  46.37 
 
 
263 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  56.83 
 
 
272 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179297  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.51 
 
 
263 aa  191  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1852  NifC-like ABC-type porter  48.18 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0537764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2303  NifC-like ABC-type porter  55.86 
 
 
257 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  53.71 
 
 
264 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.31 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  47.64 
 
 
232 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4176  NifC-like ABC-type porter  59.61 
 
 
267 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132481  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  49.78 
 
 
269 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  49.78 
 
 
269 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  49.78 
 
 
269 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  45.34 
 
 
279 aa  178  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  42.13 
 
 
273 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  39.27 
 
 
287 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  42.98 
 
 
288 aa  174  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3482  NifC-like ABC-type porter  55.17 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  43.87 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  43.87 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  49.73 
 
 
231 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  49.73 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  49.18 
 
 
231 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.72 
 
 
223 aa  168  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  44.81 
 
 
229 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  41.45 
 
 
291 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  42.48 
 
 
245 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.73 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  42.99 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  39 
 
 
270 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  44.08 
 
 
232 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  43.87 
 
 
228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.77 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  43.19 
 
 
229 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  42.48 
 
 
245 aa  161  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  42.48 
 
 
245 aa  161  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
228 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  45.02 
 
 
229 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  41.15 
 
 
240 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  45.02 
 
 
229 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  45.02 
 
 
229 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  45.02 
 
 
229 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  50.28 
 
 
231 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  45.02 
 
 
229 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
228 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  44.55 
 
 
229 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  42.65 
 
 
240 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
234 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  45.37 
 
 
232 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  42.18 
 
 
245 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  50 
 
 
239 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  42.18 
 
 
240 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  47.44 
 
 
231 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.6 
 
 
229 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  43.6 
 
 
229 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  43.6 
 
 
229 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  43.6 
 
 
229 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  43.6 
 
 
229 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  43.6 
 
 
229 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  44.08 
 
 
229 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  43.06 
 
 
230 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 
224 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  48.63 
 
 
227 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  38.67 
 
 
277 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  38.67 
 
 
277 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  38.67 
 
 
277 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  41.03 
 
 
299 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1886  NifC-like ABC-type porter  37.5 
 
 
265 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  38.07 
 
 
283 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  41.03 
 
 
299 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  38.07 
 
 
283 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4740  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  41.03 
 
 
300 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00816228  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  37.18 
 
 
308 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.12 
 
 
226 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.55 
 
 
230 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>