More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 272 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.17 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.97 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  62.3 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.11 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  56.18 
 
 		 269 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.41 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  54.55 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2905  NifC-like ABC-type porter  58.8 
 
 		 275 aa  235  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321959  hitchhiker  0.0000180969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  57.42 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1852  NifC-like ABC-type porter  55.73 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0537764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.29 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  57.87 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0223679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1068  NifC-like ABC-type porter  63.45 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  59.13 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  59.13 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  59.13 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.52 
 
 		 259 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  57.58 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  54.98 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.82 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  50.63 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  56.47 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3482  NifC-like ABC-type porter  60.5 
 
 		 291 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.52 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  57.2 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2303  NifC-like ABC-type porter  57.02 
 
 		 257 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  54.25 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4508  NifC-like ABC-type porter  55.41 
 
 		 269 aa  195  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.94 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  48.71 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4176  NifC-like ABC-type porter  61.76 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  50 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.24 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  43.91 
 
 		 288 aa  158  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  41.8 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1750  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.64 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  45.33 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  45.33 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.96 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  39.66 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.92 
 
 		 224 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  35.12 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  38.34 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  32.92 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  32.92 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  33.33 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  43.6 
 
 		 232 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  40 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3873  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  38.11 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.63 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  39.41 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  39.3 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.19 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  40.52 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  42.36 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  41.87 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  46.36 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 230 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  37.04 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  42.36 
 
 		 231 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  38.81 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  40.95 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  41.46 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  39.9 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  38.81 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  32.87 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  43.27 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 		 224 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4912  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  40.69 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.92 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  44.26 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  42.47 
 
 		 228 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.33 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  41.5 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42 
 
 		 223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  42.78 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  40.48 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12426  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysW  37.66 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0014023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  41.38 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.57 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  39.41 
 
 		 229 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  40 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  41.43 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.31 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  40.96 
 
 		 226 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  42.08 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2778  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  38.53 
 
 		 272 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3493  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  38.35 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>