More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2546 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
282 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  92.2 
 
 
282 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.73 
 
 
262 aa  374  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  75.56 
 
 
269 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  77.62 
 
 
282 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  70.61 
 
 
271 aa  343  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.8 
 
 
293 aa  342  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  73.91 
 
 
259 aa  310  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.78 
 
 
273 aa  308  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  63.44 
 
 
338 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  55.69 
 
 
267 aa  257  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  64.94 
 
 
315 aa  244  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20040  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  59.23 
 
 
287 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0133596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  49.36 
 
 
270 aa  219  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  54.25 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0223679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3860  NifC-like ABC-type porter  51.5 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167461  normal  0.0401686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1100  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  54.98 
 
 
260 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1232  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.77 
 
 
286 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2537  NifC-like ABC-type porter  51.31 
 
 
269 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2905  NifC-like ABC-type porter  53.5 
 
 
275 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321959  hitchhiker  0.0000180969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34130  NifC-like ABC-type porter/molybdate ABC transporter, permease protein  56.43 
 
 
272 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179297  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3747  NifC-like ABC-type porter  54.47 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4508  NifC-like ABC-type porter  54.98 
 
 
269 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.13 
 
 
263 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  42.02 
 
 
287 aa  188  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  46.77 
 
 
263 aa  188  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  44.68 
 
 
288 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2809  NifC-like ABC-type porter  54.88 
 
 
292 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  46.19 
 
 
279 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.48 
 
 
275 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1068  NifC-like ABC-type porter  53.51 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1750  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.96 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  40.68 
 
 
273 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1852  NifC-like ABC-type porter  49.79 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0537764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4176  NifC-like ABC-type porter  57.84 
 
 
267 aa  178  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  44.86 
 
 
271 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  47.09 
 
 
229 aa  175  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  48.7 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  48.7 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  48.7 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3482  NifC-like ABC-type porter  55.34 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.53 
 
 
223 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  46.54 
 
 
232 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  47.22 
 
 
232 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  49.04 
 
 
231 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  43.87 
 
 
229 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  49.74 
 
 
232 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  36.02 
 
 
266 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.45 
 
 
229 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  36.02 
 
 
266 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  51.98 
 
 
231 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  36.02 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  51.1 
 
 
231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.55 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  51.1 
 
 
231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  45.62 
 
 
228 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  45.89 
 
 
264 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  45.62 
 
 
228 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  43.19 
 
 
229 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.51 
 
 
230 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  48.72 
 
 
227 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.51 
 
 
230 aa  161  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  38.91 
 
 
266 aa  161  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  38.94 
 
 
270 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  51.1 
 
 
231 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  44.75 
 
 
230 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  43.93 
 
 
245 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  43.26 
 
 
240 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
226 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2498  NifC-like ABC-type porter  49.78 
 
 
244 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  43.72 
 
 
240 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2303  NifC-like ABC-type porter  53.04 
 
 
257 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  43.26 
 
 
245 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  48.54 
 
 
229 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  49.03 
 
 
229 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 
230 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  43.26 
 
 
240 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  49.03 
 
 
229 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  46.92 
 
 
231 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  52.31 
 
 
231 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  49.03 
 
 
229 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  49.03 
 
 
229 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  49.03 
 
 
229 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  44.64 
 
 
253 aa  156  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 
234 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  43.66 
 
 
228 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  43.93 
 
 
245 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  43.93 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  43.93 
 
 
245 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.75 
 
 
292 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.89 
 
 
277 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.89 
 
 
277 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.27 
 
 
230 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  37.89 
 
 
277 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.16 
 
 
235 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  43.09 
 
 
279 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  48.59 
 
 
233 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  49.15 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  35.23 
 
 
270 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>