More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3196 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  100 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  99.59 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  99.18 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  93.47 
 
 		 245 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  92.08 
 
 		 240 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  94.71 
 
 		 245 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  94.27 
 
 		 240 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  94.71 
 
 		 240 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  72.89 
 
 		 228 aa  334  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  72.44 
 
 		 229 aa  333  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  70.22 
 
 		 229 aa  327  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  69.57 
 
 		 231 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  69.57 
 
 		 231 aa  322  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  69.57 
 
 		 231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.44 
 
 		 229 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  69.64 
 
 		 232 aa  312  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  71.11 
 
 		 229 aa  310  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  73.57 
 
 		 229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  73.57 
 
 		 229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  73.57 
 
 		 229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  73.57 
 
 		 229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  73.57 
 
 		 229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  66.07 
 
 		 228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  69.78 
 
 		 229 aa  303  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  65.62 
 
 		 229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  71.11 
 
 		 229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  72.44 
 
 		 229 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  71.11 
 
 		 229 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  71.11 
 
 		 229 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  71.11 
 
 		 229 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  71.11 
 
 		 229 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  71.11 
 
 		 229 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  71.11 
 
 		 229 aa  294  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  62.16 
 
 		 230 aa  284  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  63.04 
 
 		 236 aa  278  8e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  59.03 
 
 		 232 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  61.33 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  55.65 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  59.38 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  57.59 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.27 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  58.22 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.83 
 
 		 230 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  56.96 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  56.05 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  53.57 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  59.6 
 
 		 231 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.93 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  54.88 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.31 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.04 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.04 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  56.56 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.79 
 
 		 244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  52.83 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  52.83 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  56.76 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.27 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  63.77 
 
 		 239 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  56.44 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  52.38 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.58 
 
 		 229 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  53.64 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  49.36 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.13 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  46.78 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  45.81 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.76 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.45 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.36 
 
 		 227 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.78 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.64 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 		 227 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  47.96 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.95 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.38 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.62 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.13 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.13 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.01 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.19 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  42.99 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.66 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.69 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.13 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.64 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  41.36 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 		 282 aa  168  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.36 
 
 		 293 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  42.38 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  49.3 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  40.09 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  43.72 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.81 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.64 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  41.36 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  43.72 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>